More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1768 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  99.77 
 
 
432 aa  850    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  99.77 
 
 
432 aa  850    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  100 
 
 
441 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  76.07 
 
 
443 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  78.78 
 
 
443 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  96.15 
 
 
441 aa  822    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  100 
 
 
441 aa  870    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  99.77 
 
 
432 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  78.78 
 
 
443 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  100 
 
 
441 aa  870    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  100 
 
 
441 aa  870    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  78.78 
 
 
443 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  73.83 
 
 
444 aa  634    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  71.69 
 
 
443 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  70.79 
 
 
461 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  71.33 
 
 
468 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  70.36 
 
 
454 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  54.24 
 
 
454 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  54.24 
 
 
454 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  53.05 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  52.57 
 
 
473 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  49.55 
 
 
457 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  50.44 
 
 
469 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  49.52 
 
 
452 aa  348  8e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  45.68 
 
 
492 aa  322  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  45.6 
 
 
478 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  45.6 
 
 
478 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  42.51 
 
 
483 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  40.45 
 
 
453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  42.78 
 
 
419 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  41.27 
 
 
416 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  40.29 
 
 
416 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  38.55 
 
 
461 aa  256  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  39.71 
 
 
422 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  40.29 
 
 
408 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  38.13 
 
 
484 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  39.14 
 
 
482 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  39.09 
 
 
493 aa  242  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  39.1 
 
 
419 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  38.67 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  35.97 
 
 
477 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  36.88 
 
 
482 aa  229  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  34.74 
 
 
490 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  36.9 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  34.16 
 
 
526 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  37.41 
 
 
460 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  40.61 
 
 
431 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
464 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  36.51 
 
 
460 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  36.21 
 
 
496 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  34.79 
 
 
493 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  36.34 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  33.09 
 
 
484 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  32.85 
 
 
487 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  34.4 
 
 
517 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  36.14 
 
 
492 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  35.9 
 
 
482 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  35.9 
 
 
482 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  35.9 
 
 
482 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  35.9 
 
 
482 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  33.25 
 
 
483 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  35.9 
 
 
482 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  35.9 
 
 
482 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  36.03 
 
 
473 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  32.84 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  31.71 
 
 
478 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  35.05 
 
 
491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  34.22 
 
 
499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  33.02 
 
 
530 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  33.63 
 
 
571 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  31.49 
 
 
574 aa  179  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  34.44 
 
 
461 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  34.45 
 
 
620 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  34.44 
 
 
461 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  33.49 
 
 
539 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  38.39 
 
 
634 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  33.42 
 
 
497 aa  176  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  31.87 
 
 
479 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  31.93 
 
 
497 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  33.59 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  38.38 
 
 
642 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  38.38 
 
 
646 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  38.38 
 
 
642 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  32.19 
 
 
502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  34.69 
 
 
474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  40.07 
 
 
479 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  36.33 
 
 
622 aa  172  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  30.37 
 
 
514 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  31.81 
 
 
480 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  38.08 
 
 
657 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  29.26 
 
 
487 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  36.49 
 
 
656 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  38.25 
 
 
679 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  36.42 
 
 
652 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  29.98 
 
 
486 aa  169  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  37.04 
 
 
520 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  35.96 
 
 
491 aa  169  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  37.89 
 
 
690 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  37.54 
 
 
690 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  37.89 
 
 
690 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>