More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0723 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  65.59 
 
 
516 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  100 
 
 
507 aa  1009    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  57.36 
 
 
525 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  53.35 
 
 
524 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  52.8 
 
 
499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  49.61 
 
 
499 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  46.95 
 
 
512 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  39.21 
 
 
486 aa  349  7e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  39.01 
 
 
493 aa  348  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  41.13 
 
 
497 aa  346  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  40.99 
 
 
479 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  39.58 
 
 
492 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  41.9 
 
 
480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  41.34 
 
 
489 aa  336  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  41.26 
 
 
491 aa  330  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  41.47 
 
 
480 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  38.19 
 
 
499 aa  299  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  37.16 
 
 
491 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  37.07 
 
 
546 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  37.4 
 
 
502 aa  294  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  37.45 
 
 
501 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  36.79 
 
 
502 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  37.01 
 
 
494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  34.93 
 
 
545 aa  266  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  32.69 
 
 
497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  31.67 
 
 
461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  31.74 
 
 
461 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  31.74 
 
 
461 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  32.42 
 
 
474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  32.06 
 
 
526 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  32.29 
 
 
620 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  31.73 
 
 
483 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  35.18 
 
 
493 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  33.01 
 
 
634 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  31.55 
 
 
539 aa  202  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  32.95 
 
 
663 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  31.15 
 
 
482 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  31.09 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  31.46 
 
 
487 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  30.51 
 
 
482 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  31.39 
 
 
633 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  34.05 
 
 
478 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  33.41 
 
 
595 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  31.88 
 
 
478 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  31.73 
 
 
603 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  31.63 
 
 
463 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  32.81 
 
 
679 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
642 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
642 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
646 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  31.06 
 
 
514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  32.16 
 
 
475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  29.71 
 
 
466 aa  190  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  33.11 
 
 
530 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  32.75 
 
 
700 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  33.11 
 
 
690 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  31.29 
 
 
657 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  31.56 
 
 
474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  31.51 
 
 
652 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  32.13 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  31.76 
 
 
517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  33.11 
 
 
690 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  30.43 
 
 
656 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  33.11 
 
 
690 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  30.04 
 
 
466 aa  183  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  31.82 
 
 
460 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  29.98 
 
 
492 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  30.04 
 
 
464 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  31.56 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  32.71 
 
 
482 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  32.71 
 
 
482 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  32.71 
 
 
482 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  32.71 
 
 
482 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  32.71 
 
 
482 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  32.71 
 
 
482 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  34.57 
 
 
473 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  31.15 
 
 
496 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  32.55 
 
 
574 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  28.95 
 
 
493 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  31.74 
 
 
571 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  28.52 
 
 
490 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  29.94 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  29.8 
 
 
461 aa  163  9e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  29.82 
 
 
507 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  31.15 
 
 
486 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  30.18 
 
 
491 aa  160  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  27.97 
 
 
445 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  30.79 
 
 
455 aa  157  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  30.67 
 
 
479 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  31.01 
 
 
504 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  28.02 
 
 
510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  29.75 
 
 
487 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  29.71 
 
 
484 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  27.44 
 
 
495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  27.54 
 
 
446 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  28.31 
 
 
494 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  28.72 
 
 
520 aa  141  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03353  Flp pilus assembly protein secretin  26.55 
 
 
449 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  36.33 
 
 
428 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  30.47 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>