More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0605 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 446 aa  902    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  54.63 
 
 		 456 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03353  Flp pilus assembly protein secretin  54.32 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  39.78 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  37.84 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  37.61 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  30.52 
 
 		 526 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  27.98 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  27.72 
 
 		 463 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  27.74 
 
 		 475 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  27.77 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  27.83 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  28.71 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  28.71 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  28.71 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  28.71 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  28.71 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  27.6 
 
 		 460 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  29.21 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  28.14 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 474 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  31.44 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  28.17 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  30.07 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  31.87 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  30.58 
 
 		 517 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  29.61 
 
 		 484 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  29.34 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  31.92 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  28.13 
 
 		 482 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  40.38 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  40.25 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  28.23 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  41.62 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  30.75 
 
 		 428 aa  153  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  26.46 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  30.1 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  26.22 
 
 		 495 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  29.53 
 
 		 490 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  47.34 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  36.33 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  36.33 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  48.57 
 
 		 452 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  29.02 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  46.06 
 
 		 468 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  46.67 
 
 		 454 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  28.07 
 
 		 482 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  25.86 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  41.94 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  38.34 
 
 		 473 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  28.92 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  26.57 
 
 		 574 aa  147  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  29.9 
 
 		 512 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  26.22 
 
 		 461 aa  146  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  28.88 
 
 		 455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  41.94 
 
 		 461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  27.54 
 
 		 507 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  40.11 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  42.94 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  42.47 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  43.55 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  47.59 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  27.07 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  27.91 
 
 		 491 aa  143  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  26.11 
 
 		 483 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  44.44 
 
 		 443 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  28.2 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  27.55 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  43.11 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  27.25 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  27.18 
 
 		 507 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  27.95 
 
 		 461 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  27.95 
 
 		 461 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  44.44 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  28.88 
 
 		 530 aa  141  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  44.44 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  44.44 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  44.44 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  44.44 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  44.44 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  44.44 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  44.44 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  26.62 
 
 		 525 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  26.85 
 
 		 524 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  25.19 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  41.57 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  27.4 
 
 		 595 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  43.83 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  27.93 
 
 		 497 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  43.83 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  43.83 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  26.17 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  28.94 
 
 		 700 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  37.97 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  39.69 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  37.97 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  31.29 
 
 		 479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  27.04 
 
 		 486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  27.16 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>