More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1519 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  69.65 
 
 		 530 aa  677    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  100 
 
 		 496 aa  991    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  48.43 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  41.43 
 
 		 495 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  41.85 
 
 		 464 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  40.78 
 
 		 466 aa  312  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  39.86 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  38.99 
 
 		 461 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  38.78 
 
 		 461 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  39.3 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  39.49 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  38.84 
 
 		 474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  36.35 
 
 		 482 aa  256  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  36.67 
 
 		 466 aa  249  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  36.5 
 
 		 484 aa  243  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  36.64 
 
 		 460 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  37.98 
 
 		 460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  36.28 
 
 		 460 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  35.08 
 
 		 490 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  34.69 
 
 		 483 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  35.79 
 
 		 477 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  36.54 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  36.54 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  35.05 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  36.54 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  36.54 
 
 		 482 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  36.54 
 
 		 482 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  36.54 
 
 		 482 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  35.55 
 
 		 478 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  35.51 
 
 		 491 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  38.04 
 
 		 487 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  37.59 
 
 		 484 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  37.14 
 
 		 468 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  35.17 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  37.38 
 
 		 454 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  33.89 
 
 		 493 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  34.87 
 
 		 491 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  32.09 
 
 		 489 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  36.07 
 
 		 620 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 480 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  35.58 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  33.47 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  32.12 
 
 		 525 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  34.14 
 
 		 455 aa  203  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  33.6 
 
 		 574 aa  202  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  34.36 
 
 		 539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  32.73 
 
 		 497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  36.54 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  36.54 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  36.45 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  34.25 
 
 		 633 aa  200  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  33.56 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  33.47 
 
 		 595 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  35.75 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  32.32 
 
 		 571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  37.62 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 493 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  32.72 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  36.21 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  36.21 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  36.21 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  36.21 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  36.21 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  36.21 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  36.21 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  33.41 
 
 		 526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  31.67 
 
 		 487 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 		 663 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  30.94 
 
 		 545 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  35.47 
 
 		 461 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  31.97 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  33.56 
 
 		 491 aa  193  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  30.72 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  40.32 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  31.02 
 
 		 501 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  34.63 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  30.91 
 
 		 478 aa  192  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  39.87 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  33.49 
 
 		 652 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  43.82 
 
 		 416 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  31.21 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  36.5 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  36.5 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  36.5 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  30.79 
 
 		 546 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  31.35 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  31.46 
 
 		 494 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  34.25 
 
 		 646 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  34.25 
 
 		 642 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  35.11 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  34.25 
 
 		 642 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  31.05 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  42.75 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  35.52 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  32.91 
 
 		 634 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  34.23 
 
 		 656 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  31.29 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  33.92 
 
 		 478 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>