More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1521 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  80.71 
 
 
432 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  80.71 
 
 
432 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  78.78 
 
 
441 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  94.58 
 
 
443 aa  818    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  80.22 
 
 
441 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  78.78 
 
 
441 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  100 
 
 
443 aa  877    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  100 
 
 
443 aa  877    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  78.78 
 
 
441 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  80.71 
 
 
432 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  78.78 
 
 
441 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  73.65 
 
 
444 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  100 
 
 
443 aa  877    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  70.69 
 
 
461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  70.47 
 
 
443 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  69.16 
 
 
468 aa  571  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  67.95 
 
 
454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  53.9 
 
 
454 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  53.9 
 
 
454 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  52.4 
 
 
473 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  53.65 
 
 
454 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  51.3 
 
 
469 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  48.12 
 
 
457 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  50.86 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  41.73 
 
 
492 aa  312  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  44.94 
 
 
478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  44.94 
 
 
478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  40.58 
 
 
483 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  39.47 
 
 
461 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  40.25 
 
 
453 aa  259  9e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  41.05 
 
 
422 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  41.41 
 
 
419 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  40.44 
 
 
416 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  40.8 
 
 
416 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  40.05 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  36.12 
 
 
484 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  37.78 
 
 
482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  37.16 
 
 
477 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 
493 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  39.9 
 
 
428 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  38.27 
 
 
419 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  34.27 
 
 
490 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  35.28 
 
 
482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  42.62 
 
 
431 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  33.93 
 
 
526 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  33.58 
 
 
464 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  34.24 
 
 
455 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  33.68 
 
 
493 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  33.82 
 
 
484 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  33.82 
 
 
487 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  36.5 
 
 
496 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  33.75 
 
 
466 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  33.49 
 
 
492 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  33.5 
 
 
517 aa  192  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  34.41 
 
 
460 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  34.18 
 
 
460 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  34.78 
 
 
460 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  32.86 
 
 
482 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  32.86 
 
 
482 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  32.86 
 
 
482 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  33.01 
 
 
482 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  33.01 
 
 
482 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  33.01 
 
 
482 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  36.06 
 
 
530 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  38.46 
 
 
473 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  31.41 
 
 
483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  33.17 
 
 
499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  31 
 
 
486 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  34.05 
 
 
478 aa  179  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  33.86 
 
 
491 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  38.49 
 
 
520 aa  177  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  51.23 
 
 
539 aa  177  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
571 aa  176  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  31.44 
 
 
497 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  36.96 
 
 
622 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  30.44 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  31.6 
 
 
502 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  31.69 
 
 
652 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  33.03 
 
 
494 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  31.16 
 
 
574 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  34.15 
 
 
474 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  31.41 
 
 
502 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  29.7 
 
 
514 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  39.24 
 
 
479 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  38.46 
 
 
657 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  31.72 
 
 
646 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  30.96 
 
 
480 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  31.72 
 
 
642 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  31.72 
 
 
642 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2310  type II and III secretion system protein  32.54 
 
 
443 aa  168  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  38.1 
 
 
656 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  30.12 
 
 
492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  33.06 
 
 
497 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  39.34 
 
 
679 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  39.34 
 
 
690 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  39.34 
 
 
690 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  39.34 
 
 
690 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  37.64 
 
 
634 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  29.51 
 
 
480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  30.86 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>