More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2360 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  72.36 
 
 		 493 aa  650    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  100 
 
 		 482 aa  980    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  63.56 
 
 		 484 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  51.13 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  46.15 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  42.52 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  42.32 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  40.99 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  40.77 
 
 		 474 aa  312  6.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  41.78 
 
 		 466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  39.87 
 
 		 497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  37.97 
 
 		 478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  37.34 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  38.35 
 
 		 574 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  35.85 
 
 		 487 aa  279  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  39.73 
 
 		 652 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  38.5 
 
 		 514 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  39.21 
 
 		 663 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  39.5 
 
 		 679 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  37.53 
 
 		 517 aa  277  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  39.12 
 
 		 690 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  39.12 
 
 		 690 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  39.04 
 
 		 646 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  39.04 
 
 		 642 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  39.04 
 
 		 642 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  38.5 
 
 		 657 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  38.76 
 
 		 690 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  38.8 
 
 		 620 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  38.13 
 
 		 656 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  38.01 
 
 		 633 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  37.16 
 
 		 477 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  36.02 
 
 		 571 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  37.87 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  35.47 
 
 		 507 aa  259  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  39.15 
 
 		 539 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  34.89 
 
 		 486 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  36.52 
 
 		 603 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  38.32 
 
 		 491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  35.05 
 
 		 595 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  35.64 
 
 		 466 aa  253  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  37.83 
 
 		 493 aa  252  8.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  36.67 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  35.18 
 
 		 700 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  37.78 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  37.16 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  35.44 
 
 		 479 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  34.15 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  35.07 
 
 		 634 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  38.36 
 
 		 460 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  37.15 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  34.75 
 
 		 497 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  34.7 
 
 		 501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  38.01 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  38.01 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  38.01 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  38.01 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  33.25 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  38.33 
 
 		 432 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  38.33 
 
 		 432 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  38.33 
 
 		 432 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  36.74 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  33.57 
 
 		 489 aa  233  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  34.49 
 
 		 493 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  37.56 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  34.44 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  36.32 
 
 		 461 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  35.94 
 
 		 492 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  37.41 
 
 		 484 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  36.25 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  34.7 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  36.66 
 
 		 443 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  37.78 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  34.31 
 
 		 622 aa  226  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  37.78 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  37.78 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  33.03 
 
 		 499 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  37.06 
 
 		 457 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  34.51 
 
 		 516 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  34.1 
 
 		 491 aa  223  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  37.56 
 
 		 468 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  33.26 
 
 		 545 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  38.29 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  36.43 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  36.43 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  36.55 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  36.43 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  36.43 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  36.43 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  36.43 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  37.59 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  35.78 
 
 		 469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  36.54 
 
 		 443 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  31.01 
 
 		 502 aa  217  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  33.69 
 
 		 495 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  33.25 
 
 		 454 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  33.25 
 
 		 454 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  35.17 
 
 		 496 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  34.15 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  30.86 
 
 		 502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  32.41 
 
 		 524 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>