More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0233 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 491 aa  986    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  53.16 
 
 		 491 aa  488  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  46.61 
 
 		 545 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  46.67 
 
 		 493 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  47.19 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  48.2 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  46.49 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  46.23 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  47.43 
 
 		 492 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  47.29 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  45.04 
 
 		 489 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  40.94 
 
 		 524 aa  349  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  40.04 
 
 		 525 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  40.64 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  41.32 
 
 		 499 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  40.29 
 
 		 516 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  40.66 
 
 		 499 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  40.78 
 
 		 507 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  41.41 
 
 		 502 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  41 
 
 		 502 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  40.67 
 
 		 501 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  39.43 
 
 		 546 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  40.89 
 
 		 494 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  38.91 
 
 		 512 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  37.95 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  35.5 
 
 		 478 aa  272  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  38.1 
 
 		 461 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  37.78 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  38.44 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  36.14 
 
 		 497 aa  267  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  37.93 
 
 		 493 aa  266  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  35 
 
 		 526 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  35.33 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  35.44 
 
 		 539 aa  257  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  35.28 
 
 		 460 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  38.13 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  36.42 
 
 		 620 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  33.11 
 
 		 483 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  36.88 
 
 		 484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  35.23 
 
 		 460 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  38.55 
 
 		 493 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  35.45 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  33.18 
 
 		 487 aa  246  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  38.24 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  35.54 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  36.54 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  35.54 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  35.54 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  35.54 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  35.54 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  35.54 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  35.31 
 
 		 492 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  35.8 
 
 		 633 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  34.3 
 
 		 473 aa  238  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  34.7 
 
 		 466 aa  233  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  33.94 
 
 		 663 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  34.7 
 
 		 642 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  34.7 
 
 		 642 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  34.7 
 
 		 646 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  33.94 
 
 		 652 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  34.73 
 
 		 595 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  35.63 
 
 		 690 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  34.49 
 
 		 657 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  35.63 
 
 		 690 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  34.99 
 
 		 679 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  34.11 
 
 		 656 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  35.08 
 
 		 690 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  33.72 
 
 		 517 aa  223  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  31.37 
 
 		 603 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  33.41 
 
 		 514 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  34.47 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  32.69 
 
 		 455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  31.39 
 
 		 700 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  33.56 
 
 		 474 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  32.54 
 
 		 634 aa  213  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  34.26 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  34.37 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  33.04 
 
 		 574 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  32.01 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  33.04 
 
 		 571 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  33.26 
 
 		 530 aa  199  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  31.13 
 
 		 477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  32.89 
 
 		 490 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  32.37 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  31.89 
 
 		 495 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  32.05 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  34.77 
 
 		 504 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  35.25 
 
 		 441 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  33.04 
 
 		 479 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  42.08 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  34.2 
 
 		 441 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  34.2 
 
 		 441 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  34.2 
 
 		 441 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  34.2 
 
 		 441 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  34.2 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  34.2 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  34.2 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  29.9 
 
 		 445 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  33.25 
 
 		 468 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  33.86 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>