More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4445 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 457 aa  918    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  49.41 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  49.18 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  48.87 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  51.31 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  51.31 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  51.31 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  49.55 
 
 		 441 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  49.01 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  49.55 
 
 		 441 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  49.55 
 
 		 441 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  49.55 
 
 		 441 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  49.76 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  48.12 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  48.12 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  48.12 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  49.76 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  47.36 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  47.36 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  47.98 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  48.38 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  48.24 
 
 		 454 aa  356  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  47.88 
 
 		 469 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  45.48 
 
 		 473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  48.25 
 
 		 452 aa  325  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  44.07 
 
 		 478 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  44.07 
 
 		 478 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  40.24 
 
 		 483 aa  266  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  43.44 
 
 		 408 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  44.1 
 
 		 416 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  40.9 
 
 		 484 aa  253  7e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  39 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  39.69 
 
 		 419 aa  246  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  38.14 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  39.65 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  38.66 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  36.82 
 
 		 419 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  35.68 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  36.25 
 
 		 428 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  39.28 
 
 		 482 aa  223  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  37.06 
 
 		 482 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  33.65 
 
 		 477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  34.33 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  34.92 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  34.74 
 
 		 460 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  33.61 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  40.27 
 
 		 493 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  32.23 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  36.15 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  34.38 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  35.96 
 
 		 431 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  34.93 
 
 		 539 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  36.48 
 
 		 496 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  32.31 
 
 		 466 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  33.57 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  37.24 
 
 		 492 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  34.41 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  34.41 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  34.41 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  34.41 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  34.41 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  34.41 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  35.6 
 
 		 530 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  42.08 
 
 		 491 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  39.74 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  33.24 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  32.06 
 
 		 486 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  30.41 
 
 		 478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  33.66 
 
 		 514 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  31.12 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  31.06 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  32.62 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  34.09 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  31.23 
 
 		 480 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  36.06 
 
 		 461 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  38.21 
 
 		 520 aa  170  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  36.79 
 
 		 473 aa  169  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  42.41 
 
 		 634 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  40.62 
 
 		 633 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  39.29 
 
 		 652 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  36.6 
 
 		 494 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  36.63 
 
 		 479 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  35.94 
 
 		 461 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  30.49 
 
 		 480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  51.2 
 
 		 679 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  37.58 
 
 		 497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  37.54 
 
 		 657 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  33.86 
 
 		 499 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  37.77 
 
 		 507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  31.57 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  35.92 
 
 		 603 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  39.37 
 
 		 656 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  37.22 
 
 		 642 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  35.96 
 
 		 571 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  37.22 
 
 		 642 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  37.22 
 
 		 646 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  50.3 
 
 		 690 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  50.3 
 
 		 690 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  50.3 
 
 		 690 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>