More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0481 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  100 
 
 
491 aa  971    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  40.29 
 
 
473 aa  313  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  38.46 
 
 
460 aa  236  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  35.9 
 
 
460 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  34.83 
 
 
460 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  34.75 
 
 
539 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  32.96 
 
 
464 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  34.86 
 
 
493 aa  225  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  36.26 
 
 
482 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  36.26 
 
 
482 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  36.26 
 
 
482 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  36.26 
 
 
482 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  36.26 
 
 
482 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  36.26 
 
 
482 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  36.26 
 
 
492 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  33.48 
 
 
489 aa  220  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  34.74 
 
 
479 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  34.88 
 
 
474 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  34.75 
 
 
480 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  32.84 
 
 
466 aa  216  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  32.55 
 
 
526 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  33.97 
 
 
486 aa  212  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  32.82 
 
 
461 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  33.04 
 
 
461 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  33.41 
 
 
493 aa  210  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  33.26 
 
 
482 aa  210  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  32.6 
 
 
461 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  34.13 
 
 
475 aa  209  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  33.08 
 
 
463 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  32.05 
 
 
499 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  33.49 
 
 
484 aa  206  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  33.92 
 
 
480 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  32.05 
 
 
501 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  32.28 
 
 
491 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  33.57 
 
 
478 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  33.86 
 
 
491 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  32.68 
 
 
482 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  32.19 
 
 
502 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  35.9 
 
 
492 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  31.38 
 
 
502 aa  202  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  31.9 
 
 
494 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  33.49 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  30.75 
 
 
483 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  33.33 
 
 
496 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  34.07 
 
 
466 aa  193  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  30.04 
 
 
507 aa  192  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  33.89 
 
 
646 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  33.42 
 
 
474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  33.89 
 
 
642 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  33.89 
 
 
642 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  30.49 
 
 
546 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  32.17 
 
 
497 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  31.54 
 
 
478 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  32.18 
 
 
477 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  34.4 
 
 
461 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  33.25 
 
 
495 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  32.46 
 
 
652 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  29.82 
 
 
499 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  32.63 
 
 
657 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  32.47 
 
 
656 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  30.95 
 
 
517 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  35.44 
 
 
633 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  32.7 
 
 
700 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  29.76 
 
 
499 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  30.66 
 
 
487 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  30.79 
 
 
493 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
690 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  31.47 
 
 
530 aa  176  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  33.33 
 
 
690 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  29.89 
 
 
516 aa  176  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  31.16 
 
 
622 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  32.42 
 
 
571 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  32.59 
 
 
514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  32.52 
 
 
620 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  33.87 
 
 
679 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  30.32 
 
 
490 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  33.1 
 
 
663 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 
478 aa  172  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  32.39 
 
 
478 aa  172  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  32.8 
 
 
457 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  32.79 
 
 
690 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  40.66 
 
 
483 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  30.14 
 
 
595 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
484 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  28.25 
 
 
524 aa  170  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
487 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  30.19 
 
 
574 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  29.38 
 
 
453 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  32.12 
 
 
479 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  28.36 
 
 
545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  36.86 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  31.21 
 
 
455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  29.29 
 
 
512 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  30.02 
 
 
507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  32.14 
 
 
603 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 
461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  31.31 
 
 
444 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  38.4 
 
 
468 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  35.88 
 
 
454 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  35.88 
 
 
454 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.218711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>