More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1885 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  70.64 
 
 
460 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  99.79 
 
 
482 aa  948    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  100 
 
 
482 aa  951    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  100 
 
 
482 aa  951    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  71.74 
 
 
460 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  71.08 
 
 
460 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  99.79 
 
 
482 aa  948    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  92.32 
 
 
492 aa  839    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  100 
 
 
482 aa  951    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  99.79 
 
 
482 aa  948    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  36.85 
 
 
539 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  39.18 
 
 
473 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  37.23 
 
 
493 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  36.5 
 
 
475 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  37.23 
 
 
526 aa  262  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  37.75 
 
 
478 aa  260  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  39.02 
 
 
463 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  38.16 
 
 
484 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  38.95 
 
 
464 aa  252  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  36.29 
 
 
491 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  37.47 
 
 
474 aa  249  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  38.07 
 
 
466 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  35.54 
 
 
491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  37.89 
 
 
546 aa  242  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  37.68 
 
 
517 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  36.59 
 
 
474 aa  233  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  33.56 
 
 
479 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  34.19 
 
 
480 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  36.39 
 
 
493 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  36.46 
 
 
502 aa  229  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  37.22 
 
 
502 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  35.71 
 
 
494 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  36.54 
 
 
496 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  33.64 
 
 
480 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 
486 aa  227  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  36.84 
 
 
482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  35.64 
 
 
501 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  36.26 
 
 
491 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  37.53 
 
 
499 aa  223  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  33.57 
 
 
530 aa  223  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  34.12 
 
 
497 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  34.81 
 
 
663 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  35.54 
 
 
461 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  35.54 
 
 
461 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  34.22 
 
 
493 aa  219  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  34.81 
 
 
497 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  36.3 
 
 
482 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  34.8 
 
 
492 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  32.53 
 
 
489 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  34.57 
 
 
514 aa  217  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  35.88 
 
 
620 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  33.9 
 
 
642 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  33.9 
 
 
642 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  33.9 
 
 
646 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  35.53 
 
 
633 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  34.43 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  34.31 
 
 
657 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  35.73 
 
 
479 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  33.66 
 
 
656 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  36.59 
 
 
455 aa  210  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  33.69 
 
 
495 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  33.01 
 
 
483 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  32.6 
 
 
652 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  33.9 
 
 
690 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  33.9 
 
 
690 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  33.98 
 
 
603 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  32.96 
 
 
477 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  33.33 
 
 
690 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  33.57 
 
 
700 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  37.2 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
679 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  33.48 
 
 
574 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  36.09 
 
 
466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  33.1 
 
 
634 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  33.8 
 
 
595 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  36.49 
 
 
454 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  32.56 
 
 
525 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  32.7 
 
 
507 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  31.83 
 
 
487 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  33.48 
 
 
571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  33.03 
 
 
490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  35.2 
 
 
504 aa  190  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  32.36 
 
 
478 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  34.95 
 
 
453 aa  188  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  35.42 
 
 
441 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  35.42 
 
 
441 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  35.42 
 
 
441 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  35.42 
 
 
441 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  35.02 
 
 
441 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  34.4 
 
 
461 aa  187  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  35.97 
 
 
432 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  35.97 
 
 
432 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  35.97 
 
 
432 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  34.13 
 
 
473 aa  186  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  31.22 
 
 
516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  36.08 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  30.9 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  34.02 
 
 
419 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 
443 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 
443 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>