More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0614 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  100 
 
 
464 aa  928    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  69.96 
 
 
466 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  41.85 
 
 
496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  42.32 
 
 
530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  40.94 
 
 
479 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  39.31 
 
 
495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  41.92 
 
 
517 aa  283  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  40.23 
 
 
474 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  42.25 
 
 
461 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  42.11 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  42.61 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  37.84 
 
 
460 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  39.13 
 
 
497 aa  263  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  38.67 
 
 
460 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  36.22 
 
 
460 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  38.25 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  38.3 
 
 
492 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  38.95 
 
 
482 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  38.95 
 
 
482 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  38.95 
 
 
482 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  38.95 
 
 
482 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  38.95 
 
 
482 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  38.95 
 
 
482 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  35.17 
 
 
479 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  35.41 
 
 
480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  38.24 
 
 
491 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  34.12 
 
 
482 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  37.63 
 
 
486 aa  242  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  36.96 
 
 
484 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  35.04 
 
 
480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  34.72 
 
 
497 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  34.31 
 
 
492 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  37.4 
 
 
491 aa  229  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  34.29 
 
 
489 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  34.7 
 
 
482 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  35.78 
 
 
501 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  30.82 
 
 
483 aa  226  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  32.79 
 
 
526 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  34.94 
 
 
490 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  34.38 
 
 
473 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  34.45 
 
 
491 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  34.51 
 
 
546 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  34.91 
 
 
493 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  33.5 
 
 
493 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  32.73 
 
 
493 aa  216  8e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  31.61 
 
 
539 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  32.97 
 
 
574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  34.4 
 
 
494 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  32.06 
 
 
477 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  33.26 
 
 
502 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  30.49 
 
 
478 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  33.49 
 
 
502 aa  211  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  32.65 
 
 
507 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  33.8 
 
 
633 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  33.26 
 
 
620 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  31.92 
 
 
499 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  34.91 
 
 
646 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  34.91 
 
 
642 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  34.91 
 
 
642 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  34.04 
 
 
652 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  34.34 
 
 
690 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  34.01 
 
 
657 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  34.34 
 
 
690 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  34.27 
 
 
690 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  31.98 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  33.56 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  33.02 
 
 
487 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  31.1 
 
 
634 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  33.71 
 
 
656 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  33.56 
 
 
441 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  33.58 
 
 
443 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  33.58 
 
 
443 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
461 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  33.58 
 
 
443 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  32.45 
 
 
484 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  33.33 
 
 
441 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  33.33 
 
 
441 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  33.33 
 
 
441 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  32.21 
 
 
487 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  32.35 
 
 
571 aa  195  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  33.33 
 
 
441 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  32.53 
 
 
443 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  33.57 
 
 
432 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
679 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  33.57 
 
 
432 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  33.57 
 
 
432 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  30.57 
 
 
603 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  32.29 
 
 
443 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  34.83 
 
 
463 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  34.85 
 
 
455 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  31.66 
 
 
595 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  33.48 
 
 
525 aa  190  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  36.62 
 
 
520 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  30.99 
 
 
451 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  34 
 
 
468 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  30.79 
 
 
663 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  31.91 
 
 
514 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
478 aa  186  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  32.56 
 
 
451 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  34 
 
 
454 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>