More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0800 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 510 aa  1031    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  54.68 
 
 		 461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  53.59 
 
 		 486 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  34.42 
 
 		 514 aa  246  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  35.28 
 
 		 574 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  33.69 
 
 		 663 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  34.09 
 
 		 646 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  34.09 
 
 		 642 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  34.09 
 
 		 642 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  34.98 
 
 		 652 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  32.9 
 
 		 595 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  30.86 
 
 		 634 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  33.62 
 
 		 700 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  34.33 
 
 		 657 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  30.02 
 
 		 603 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  33.62 
 
 		 620 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  33.69 
 
 		 633 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  31.86 
 
 		 504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  32.51 
 
 		 690 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  32.64 
 
 		 690 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  30.71 
 
 		 482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  29.02 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  41.64 
 
 		 656 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  29.76 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  30.67 
 
 		 482 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  39.06 
 
 		 679 aa  167  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  30.92 
 
 		 494 aa  163  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 690 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  27.64 
 
 		 478 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  28.12 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  31.35 
 
 		 507 aa  160  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  29.1 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  29.3 
 
 		 507 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  28.21 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  29.83 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  27.48 
 
 		 455 aa  150  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  30.4 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  29.86 
 
 		 516 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  28.05 
 
 		 487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  28.47 
 
 		 479 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  30.13 
 
 		 461 aa  146  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  27.79 
 
 		 497 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  27.17 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  28.44 
 
 		 524 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  28.27 
 
 		 497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  27.75 
 
 		 486 aa  140  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  26.19 
 
 		 491 aa  137  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  27.19 
 
 		 480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  27.91 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  27.64 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  26.83 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  28.29 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  28.29 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  26.16 
 
 		 489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  26.67 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  27.84 
 
 		 512 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  27.43 
 
 		 501 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  27.18 
 
 		 474 aa  134  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  27.79 
 
 		 525 aa  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  36.88 
 
 		 491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  26.29 
 
 		 492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03353  Flp pilus assembly protein secretin  26.23 
 
 		 449 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  27.05 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  27.06 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  28.19 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  25.59 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  27.7 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  25.56 
 
 		 461 aa  127  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  28.73 
 
 		 454 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  27.52 
 
 		 496 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  28.89 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  25.11 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  25.83 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  28.24 
 
 		 451 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  27.66 
 
 		 473 aa  123  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  34.02 
 
 		 386 aa  123  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  27.36 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  36.04 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  26.09 
 
 		 475 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  28.45 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  25.91 
 
 		 502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  27.31 
 
 		 444 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  28.07 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  33.68 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  26.9 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  27 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  26.97 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  25.11 
 
 		 456 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  25.16 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  24.72 
 
 		 423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  32.23 
 
 		 622 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  28.76 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  30.56 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  28.18 
 
 		 482 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  28.18 
 
 		 482 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  26.37 
 
 		 493 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  28.18 
 
 		 482 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  32.08 
 
 		 408 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  28.18 
 
 		 482 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  28.18 
 
 		 482 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>