More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0794 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  100 
 
 
622 aa  1242    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  36.06 
 
 
484 aa  238  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  34.83 
 
 
482 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  34.27 
 
 
493 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  33.86 
 
 
477 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  34.02 
 
 
482 aa  217  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  33.92 
 
 
461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  31.55 
 
 
490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  31.77 
 
 
460 aa  190  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  31 
 
 
474 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  33.67 
 
 
461 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  31.33 
 
 
497 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 
466 aa  183  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  32.91 
 
 
461 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  32.37 
 
 
571 aa  181  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  31.25 
 
 
460 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  31.36 
 
 
461 aa  178  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  31.36 
 
 
460 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  30.33 
 
 
483 aa  176  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  32.32 
 
 
492 aa  176  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  31.16 
 
 
491 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  31.83 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  31.83 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  31.83 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  31.83 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  31.83 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  31.83 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  28.92 
 
 
526 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  30.36 
 
 
517 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  30.1 
 
 
494 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  29.17 
 
 
464 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  30.32 
 
 
501 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  32.3 
 
 
431 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  30.17 
 
 
478 aa  170  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  30.12 
 
 
479 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  32.35 
 
 
642 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  32.35 
 
 
646 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  29.88 
 
 
455 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  32.35 
 
 
642 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  32.03 
 
 
652 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  32.76 
 
 
657 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  29.21 
 
 
480 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  32.6 
 
 
656 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  30.19 
 
 
502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  34.01 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  34.01 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  29.88 
 
 
502 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  29.4 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  36.96 
 
 
443 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  36.96 
 
 
443 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  36.96 
 
 
443 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  35.05 
 
 
454 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  36.33 
 
 
441 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  36.33 
 
 
441 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  36.33 
 
 
441 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  36.33 
 
 
441 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  37.84 
 
 
432 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  37.84 
 
 
432 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  37.84 
 
 
432 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  30.69 
 
 
487 aa  163  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  31.22 
 
 
539 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  30.14 
 
 
499 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  36.55 
 
 
443 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  31.22 
 
 
633 aa  161  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  32.36 
 
 
679 aa  160  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  34.77 
 
 
441 aa  160  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  31.37 
 
 
620 aa  160  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  30.67 
 
 
466 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  35.98 
 
 
443 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  28.16 
 
 
486 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  31.78 
 
 
690 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  31.78 
 
 
690 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  29.62 
 
 
492 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  28.64 
 
 
480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  34.48 
 
 
483 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  32.93 
 
 
473 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  31.48 
 
 
690 aa  157  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  38.59 
 
 
468 aa  156  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3839  type II and III secretion system protein  24.88 
 
 
772 aa  156  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  38.17 
 
 
454 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  30 
 
 
491 aa  156  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 
444 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  29.41 
 
 
493 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  30.07 
 
 
484 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  29.63 
 
 
474 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  29.13 
 
 
497 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  30.39 
 
 
491 aa  155  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  30.32 
 
 
487 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  32.53 
 
 
507 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 
493 aa  153  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  34.18 
 
 
478 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  29.22 
 
 
574 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  34.18 
 
 
478 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  29.21 
 
 
545 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  35.14 
 
 
469 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  29.05 
 
 
663 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  30.3 
 
 
496 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  30.24 
 
 
479 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  28.67 
 
 
603 aa  151  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  32.14 
 
 
457 aa  151  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>