More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0609 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  64.7 
 
 		 632 aa  751    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 635 aa  1272    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  65.32 
 
 		 636 aa  773    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  54.3 
 
 		 648 aa  641    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  94.6 
 
 		 630 aa  1123    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  66.29 
 
 		 641 aa  806    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  35.77 
 
 		 799 aa  351  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  35.84 
 
 		 655 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  34.22 
 
 		 673 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  31.88 
 
 		 670 aa  310  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  32.1 
 
 		 738 aa  300  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  32.33 
 
 		 740 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  34.16 
 
 		 702 aa  293  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  32.76 
 
 		 747 aa  291  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  31.96 
 
 		 728 aa  287  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  32.71 
 
 		 703 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  33.19 
 
 		 807 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  33.58 
 
 		 803 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  33.61 
 
 		 658 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  33.11 
 
 		 776 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  30.43 
 
 		 793 aa  279  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  33.11 
 
 		 658 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  31.57 
 
 		 736 aa  276  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  32.24 
 
 		 783 aa  276  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  30.31 
 
 		 789 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  30.69 
 
 		 892 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  33.76 
 
 		 666 aa  273  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  34.2 
 
 		 725 aa  273  8.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  34.34 
 
 		 650 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  28.8 
 
 		 787 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  32.56 
 
 		 758 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  30.95 
 
 		 717 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  34.5 
 
 		 649 aa  266  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  28.96 
 
 		 750 aa  266  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  30.78 
 
 		 753 aa  264  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  31.85 
 
 		 662 aa  262  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  32.83 
 
 		 645 aa  261  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  32.67 
 
 		 748 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  32.65 
 
 		 650 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  32.49 
 
 		 654 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  32.49 
 
 		 654 aa  258  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  32.87 
 
 		 634 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  30.1 
 
 		 650 aa  254  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2608  general secretion pathway protein D  32.02 
 
 		 842 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  31.71 
 
 		 672 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  31.73 
 
 		 640 aa  250  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  31.64 
 
 		 681 aa  250  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  32.1 
 
 		 640 aa  248  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  31.21 
 
 		 904 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  30.43 
 
 		 804 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  30.8 
 
 		 897 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  32.17 
 
 		 689 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  30.7 
 
 		 675 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  29.86 
 
 		 682 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  30.87 
 
 		 902 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  31.62 
 
 		 658 aa  240  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  30.66 
 
 		 703 aa  239  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  29.71 
 
 		 710 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  29.78 
 
 		 697 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  31.07 
 
 		 704 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  30 
 
 		 704 aa  237  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  30.32 
 
 		 706 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  29.36 
 
 		 748 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  30.61 
 
 		 640 aa  234  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  30.61 
 
 		 640 aa  234  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  30.61 
 
 		 640 aa  234  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  29.68 
 
 		 714 aa  234  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  30.37 
 
 		 705 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  31.66 
 
 		 655 aa  232  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  30.19 
 
 		 705 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  29.41 
 
 		 705 aa  232  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  29.61 
 
 		 710 aa  232  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  29.3 
 
 		 700 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  27.65 
 
 		 686 aa  232  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  29.3 
 
 		 700 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  29.68 
 
 		 702 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  28.97 
 
 		 660 aa  231  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  27.54 
 
 		 686 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  27.54 
 
 		 686 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  27.99 
 
 		 686 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  27.99 
 
 		 686 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  29.15 
 
 		 724 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  28.25 
 
 		 791 aa  226  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  30.02 
 
 		 703 aa  225  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  30.3 
 
 		 707 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  28.25 
 
 		 791 aa  224  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  31.15 
 
 		 674 aa  221  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  39.29 
 
 		 810 aa  211  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  41.54 
 
 		 805 aa  206  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  28.23 
 
 		 696 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  37.71 
 
 		 781 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  37.37 
 
 		 781 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  38.32 
 
 		 775 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  35.14 
 
 		 783 aa  193  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  38.61 
 
 		 781 aa  193  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  38.29 
 
 		 757 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  39.41 
 
 		 771 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  39.41 
 
 		 777 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  37.97 
 
 		 757 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  38.87 
 
 		 744 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>