More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18620 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 602 aa  1201    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0618  type II and III secretion system protein  24.71 
 
 		 634 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00736959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  26.12 
 
 		 1421 aa  147  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1103  type II and III secretion system protein  24.47 
 
 		 655 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00448794  hitchhiker  0.000000000241277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3195  type II general secretion pathway (GSP) D protein  21.45 
 
 		 656 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  25.13 
 
 		 881 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  26.82 
 
 		 864 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  25.24 
 
 		 946 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  23.89 
 
 		 944 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  24.76 
 
 		 926 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  28.91 
 
 		 387 aa  118  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  25.42 
 
 		 698 aa  117  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  25.42 
 
 		 698 aa  117  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  25.24 
 
 		 1269 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  23.65 
 
 		 1302 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12660  type II and III secretion system protein  27.03 
 
 		 385 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  25.92 
 
 		 893 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 387 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  24.2 
 
 		 891 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  27.06 
 
 		 1282 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.85 
 
 		 874 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  26.6 
 
 		 689 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0836  type II and III secretion system protein  26.42 
 
 		 1282 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934463  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  29.71 
 
 		 625 aa  110  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  24.6 
 
 		 710 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  24.83 
 
 		 882 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  26.86 
 
 		 682 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  24.51 
 
 		 711 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  24.6 
 
 		 887 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  24.88 
 
 		 887 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  33.8 
 
 		 544 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  23.51 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  33.8 
 
 		 530 aa  107  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  25.06 
 
 		 523 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.15 
 
 		 894 aa  107  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  24.62 
 
 		 420 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  33.81 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  25.48 
 
 		 710 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  29.33 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  30.28 
 
 		 681 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  27.33 
 
 		 492 aa  105  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  26.51 
 
 		 829 aa  104  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  28.15 
 
 		 635 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  24.37 
 
 		 420 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  35.75 
 
 		 652 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  35.64 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  27.33 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  27.33 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  27.33 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  35.64 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  35.64 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  25.24 
 
 		 591 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  27.57 
 
 		 819 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 		 641 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  34.29 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  23.76 
 
 		 870 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  29.58 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  25.36 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  37.28 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  28.62 
 
 		 660 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  32.96 
 
 		 656 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  32.2 
 
 		 386 aa  102  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  34.62 
 
 		 546 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  31.14 
 
 		 508 aa  101  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  24.47 
 
 		 699 aa  101  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  34.47 
 
 		 559 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  35.15 
 
 		 571 aa  101  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  24.17 
 
 		 711 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  32.96 
 
 		 657 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  37.58 
 
 		 494 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.8 
 
 		 567 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  25.74 
 
 		 546 aa  100  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  29.51 
 
 		 640 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  33.01 
 
 		 562 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  29.93 
 
 		 640 aa  100  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  29.93 
 
 		 640 aa  100  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 		 451 aa  100  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  24.24 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  33.7 
 
 		 507 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  36.69 
 
 		 460 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  34.26 
 
 		 549 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  33.67 
 
 		 559 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  24.24 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  24.77 
 
 		 704 aa  99.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  24.24 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  24.24 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  33.67 
 
 		 559 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  23.64 
 
 		 706 aa  99.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  27.09 
 
 		 783 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  27.89 
 
 		 649 aa  99.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  21.7 
 
 		 729 aa  98.2  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  24.24 
 
 		 527 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  24.18 
 
 		 712 aa  98.6  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  36.72 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 		 451 aa  98.2  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.62 
 
 		 556 aa  98.2  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  31.71 
 
 		 723 aa  98.2  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  25.41 
 
 		 787 aa  98.2  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  31.96 
 
 		 541 aa  97.8  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 580 aa  97.8  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>