More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2098 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 681 aa  1333    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  35.06 
 
 		 780 aa  350  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  34.68 
 
 		 745 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  34 
 
 		 720 aa  323  9.000000000000001e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  32.64 
 
 		 773 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  34.19 
 
 		 767 aa  316  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  33.03 
 
 		 772 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  32.72 
 
 		 751 aa  313  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  31.65 
 
 		 775 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  31.65 
 
 		 775 aa  310  8e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  32.11 
 
 		 774 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  32.15 
 
 		 733 aa  298  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  33 
 
 		 686 aa  291  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  41.25 
 
 		 797 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  40.79 
 
 		 794 aa  236  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  43.92 
 
 		 819 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  40.48 
 
 		 833 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  40.4 
 
 		 829 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  41.03 
 
 		 751 aa  207  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  27.21 
 
 		 752 aa  204  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  39.07 
 
 		 784 aa  200  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  39.67 
 
 		 805 aa  200  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  40.13 
 
 		 779 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  27.93 
 
 		 641 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  39.22 
 
 		 776 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  37.13 
 
 		 763 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  24.57 
 
 		 799 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  36.27 
 
 		 801 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  36.27 
 
 		 803 aa  185  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  34.32 
 
 		 793 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  34.45 
 
 		 766 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  26.19 
 
 		 635 aa  177  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  27.29 
 
 		 793 aa  173  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  29.06 
 
 		 711 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  26.53 
 
 		 787 aa  172  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  26.72 
 
 		 750 aa  171  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  27.18 
 
 		 803 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  26.76 
 
 		 740 aa  171  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  27.36 
 
 		 807 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  24.92 
 
 		 696 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  26.79 
 
 		 783 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  25.59 
 
 		 733 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  25.74 
 
 		 717 aa  158  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  26.34 
 
 		 753 aa  156  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  26.1 
 
 		 747 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  25.65 
 
 		 738 aa  154  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  25.56 
 
 		 636 aa  154  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  34.39 
 
 		 630 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  25.3 
 
 		 757 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  25.3 
 
 		 750 aa  152  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  25.3 
 
 		 757 aa  152  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  26.76 
 
 		 728 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0315  type II and III secretion system protein  26.13 
 
 		 732 aa  152  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.713775 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  25.23 
 
 		 757 aa  151  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  25.23 
 
 		 757 aa  151  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  25.23 
 
 		 757 aa  151  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  25.23 
 
 		 757 aa  151  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  26.08 
 
 		 632 aa  150  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 781 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  26.14 
 
 		 704 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  24.79 
 
 		 655 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  24.68 
 
 		 660 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  25.84 
 
 		 744 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  24.56 
 
 		 814 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  26.04 
 
 		 673 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  24.71 
 
 		 781 aa  144  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  25.22 
 
 		 789 aa  144  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  26.06 
 
 		 706 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  23.92 
 
 		 648 aa  144  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  26.33 
 
 		 748 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  25.94 
 
 		 705 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  25.79 
 
 		 705 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  25.33 
 
 		 702 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  24.21 
 
 		 654 aa  140  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  24.18 
 
 		 777 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  24.05 
 
 		 650 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  30.43 
 
 		 662 aa  140  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  24.18 
 
 		 771 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  24.05 
 
 		 654 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  26.03 
 
 		 681 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  26.03 
 
 		 700 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  26.03 
 
 		 700 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  26.58 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  23.74 
 
 		 697 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  25.2 
 
 		 704 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  26.95 
 
 		 682 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  30.94 
 
 		 783 aa  138  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  26.01 
 
 		 634 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  25.19 
 
 		 703 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  27.17 
 
 		 758 aa  137  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  24.26 
 
 		 640 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  31.87 
 
 		 803 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  25.79 
 
 		 702 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  25.29 
 
 		 736 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  24.73 
 
 		 689 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  27.52 
 
 		 776 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  24.7 
 
 		 703 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  24.72 
 
 		 640 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  24.96 
 
 		 714 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  24.22 
 
 		 705 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>