More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0003 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  54.14 
 
 		 650 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  71.16 
 
 		 640 aa  912    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  71 
 
 		 640 aa  900    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  53.82 
 
 		 654 aa  658    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 655 aa  1332    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  53.98 
 
 		 654 aa  661    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  50.61 
 
 		 660 aa  626  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  49.16 
 
 		 675 aa  595  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  49.76 
 
 		 662 aa  590  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  47.6 
 
 		 640 aa  588  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  47.6 
 
 		 640 aa  588  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  47.6 
 
 		 640 aa  588  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  48.33 
 
 		 658 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  49.28 
 
 		 672 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  48.55 
 
 		 704 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  49.43 
 
 		 700 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  49.43 
 
 		 700 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  48.56 
 
 		 704 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  47.96 
 
 		 681 aa  575  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  48.63 
 
 		 703 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  47.88 
 
 		 714 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  48.31 
 
 		 705 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  48.2 
 
 		 710 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  48.56 
 
 		 706 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  48.95 
 
 		 702 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  45.09 
 
 		 697 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  47.99 
 
 		 705 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  47.31 
 
 		 703 aa  565  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  46.34 
 
 		 689 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  49.26 
 
 		 674 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  48.25 
 
 		 710 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  46.67 
 
 		 724 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  48.36 
 
 		 707 aa  561  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  47.03 
 
 		 705 aa  554  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  45.06 
 
 		 686 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  45.06 
 
 		 686 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  45.06 
 
 		 686 aa  525  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  44.89 
 
 		 686 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  45.06 
 
 		 686 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  66.11 
 
 		 716 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  65.71 
 
 		 714 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  38.84 
 
 		 655 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  35.74 
 
 		 696 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  35.74 
 
 		 670 aa  363  8e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  35.37 
 
 		 673 aa  360  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  35.62 
 
 		 666 aa  330  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  36.82 
 
 		 650 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  35.81 
 
 		 658 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  35.23 
 
 		 658 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  36.94 
 
 		 725 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  33.44 
 
 		 650 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  34.48 
 
 		 634 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  33.79 
 
 		 645 aa  299  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  33.67 
 
 		 776 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  33.07 
 
 		 703 aa  293  7e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  33.94 
 
 		 649 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  32.77 
 
 		 758 aa  287  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  32.94 
 
 		 748 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  32.72 
 
 		 791 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  32.72 
 
 		 791 aa  279  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  33.28 
 
 		 717 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  32.88 
 
 		 757 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  33.33 
 
 		 757 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  33.33 
 
 		 757 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  33.33 
 
 		 757 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  33.33 
 
 		 757 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  33.33 
 
 		 757 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  31.01 
 
 		 682 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  30.79 
 
 		 738 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  30.92 
 
 		 753 aa  250  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  28.72 
 
 		 750 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  30.78 
 
 		 799 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  29.81 
 
 		 807 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  30.47 
 
 		 793 aa  244  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  30.98 
 
 		 736 aa  243  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  29.67 
 
 		 803 aa  240  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  29.5 
 
 		 747 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  29.41 
 
 		 728 aa  238  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  40.31 
 
 		 584 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  30.98 
 
 		 702 aa  234  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  40 
 
 		 584 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  31.53 
 
 		 635 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  27.73 
 
 		 783 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  29.77 
 
 		 740 aa  227  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  30.43 
 
 		 630 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1043  general secretion pathway protein D  40 
 
 		 584 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.54 
 
 		 641 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  28.53 
 
 		 748 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0315  type II and III secretion system protein  27.06 
 
 		 732 aa  207  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.713775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03176  general secretory pathway component, cryptic  51.93 
 
 		 338 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  28.6 
 
 		 648 aa  206  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  29.17 
 
 		 636 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03127  hypothetical protein  51.93 
 
 		 338 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0771412  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  39.49 
 
 		 744 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  28.66 
 
 		 632 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  37.38 
 
 		 787 aa  193  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  38.68 
 
 		 777 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  38.68 
 
 		 771 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  38.25 
 
 		 781 aa  191  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  37.5 
 
 		 774 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>