More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3420 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 758 aa  1496    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  57.74 
 
 		 748 aa  769    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  65.82 
 
 		 658 aa  744    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  63.46 
 
 		 658 aa  743    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  84.12 
 
 		 776 aa  1180    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  62.82 
 
 		 645 aa  713    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  49.75 
 
 		 634 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  45.66 
 
 		 649 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  40.06 
 
 		 655 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  36.93 
 
 		 750 aa  382  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  38.94 
 
 		 673 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  33.8 
 
 		 697 aa  361  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  36.21 
 
 		 689 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  35.64 
 
 		 686 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  35.48 
 
 		 686 aa  350  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  35.48 
 
 		 686 aa  350  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  35.48 
 
 		 686 aa  350  8e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  34.53 
 
 		 681 aa  348  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  35.61 
 
 		 703 aa  348  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  35.33 
 
 		 686 aa  348  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  34.37 
 
 		 662 aa  347  7e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  35.26 
 
 		 666 aa  346  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  38.9 
 
 		 650 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  33.23 
 
 		 675 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  35.25 
 
 		 670 aa  335  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  32.42 
 
 		 658 aa  334  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  33.69 
 
 		 672 aa  334  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  33.97 
 
 		 703 aa  333  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  33.59 
 
 		 705 aa  332  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  34.8 
 
 		 654 aa  332  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  36.38 
 
 		 725 aa  332  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  34.64 
 
 		 650 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  34.34 
 
 		 654 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  32.94 
 
 		 738 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  32.07 
 
 		 710 aa  326  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  33.64 
 
 		 700 aa  324  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  33.64 
 
 		 700 aa  324  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  32.89 
 
 		 714 aa  323  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  32.78 
 
 		 783 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  34.3 
 
 		 706 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  33.54 
 
 		 705 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  33.85 
 
 		 702 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  32.97 
 
 		 704 aa  320  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  32.93 
 
 		 703 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  33.93 
 
 		 704 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  34.07 
 
 		 707 aa  318  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  33.71 
 
 		 705 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  33.14 
 
 		 724 aa  316  9e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  35.16 
 
 		 650 aa  313  5.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  33.78 
 
 		 789 aa  313  9e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  33.78 
 
 		 793 aa  312  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  34.41 
 
 		 710 aa  311  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  33.14 
 
 		 717 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  32.88 
 
 		 674 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  33.39 
 
 		 660 aa  308  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  32.39 
 
 		 740 aa  308  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  33.48 
 
 		 747 aa  306  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  33.9 
 
 		 640 aa  303  9e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  34.01 
 
 		 640 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  33.43 
 
 		 736 aa  300  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  33.72 
 
 		 728 aa  300  9e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  33.22 
 
 		 655 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  32.49 
 
 		 702 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  30.81 
 
 		 803 aa  297  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0315  type II and III secretion system protein  32.23 
 
 		 732 aa  296  9e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.713775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  30.26 
 
 		 807 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  32.87 
 
 		 753 aa  290  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  30.44 
 
 		 781 aa  290  9e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  30.69 
 
 		 640 aa  289  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  30.69 
 
 		 640 aa  289  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  30.69 
 
 		 640 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  30.88 
 
 		 781 aa  286  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  32.57 
 
 		 635 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  31.42 
 
 		 641 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  28.48 
 
 		 799 aa  269  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  30.94 
 
 		 774 aa  268  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  29.87 
 
 		 791 aa  266  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  31.56 
 
 		 630 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  29.72 
 
 		 791 aa  261  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  46.63 
 
 		 682 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  32.27 
 
 		 648 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  31.81 
 
 		 636 aa  257  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  29.48 
 
 		 748 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  29.12 
 
 		 696 aa  241  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  42.26 
 
 		 787 aa  237  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  41.99 
 
 		 771 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  41.99 
 
 		 777 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  39.95 
 
 		 787 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  42.51 
 
 		 781 aa  230  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  31.13 
 
 		 632 aa  229  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  37.47 
 
 		 584 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  37.68 
 
 		 584 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  41.77 
 
 		 780 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  43.26 
 
 		 774 aa  227  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  43.26 
 
 		 774 aa  227  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  39.34 
 
 		 757 aa  225  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  41.12 
 
 		 791 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  39.34 
 
 		 750 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  39.34 
 
 		 757 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  39.34 
 
 		 757 aa  224  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>