More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2653 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 748 aa  1476    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0315  type II and III secretion system protein  55.32 
 
 		 732 aa  715    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.713775 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  34.24 
 
 		 655 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  35.39 
 
 		 789 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  33.38 
 
 		 673 aa  310  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  33 
 
 		 681 aa  303  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  34.71 
 
 		 805 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  31.31 
 
 		 686 aa  300  7e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  31.17 
 
 		 686 aa  300  9e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  31.17 
 
 		 686 aa  299  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  31.17 
 
 		 686 aa  299  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  31.17 
 
 		 686 aa  299  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  33.21 
 
 		 807 aa  299  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  33.67 
 
 		 740 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  33.76 
 
 		 793 aa  297  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  32.94 
 
 		 697 aa  296  7e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  29.95 
 
 		 750 aa  294  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  31.13 
 
 		 787 aa  293  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  32.05 
 
 		 703 aa  291  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  31.76 
 
 		 689 aa  291  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  32.91 
 
 		 803 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  32.72 
 
 		 707 aa  281  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  30.53 
 
 		 670 aa  280  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  33.09 
 
 		 728 aa  280  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  32.29 
 
 		 717 aa  280  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  32.15 
 
 		 724 aa  277  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  31.88 
 
 		 634 aa  277  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  32.71 
 
 		 783 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  31.22 
 
 		 675 aa  275  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  32.1 
 
 		 747 aa  273  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  32.67 
 
 		 738 aa  273  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  31.07 
 
 		 682 aa  271  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  31.71 
 
 		 705 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  33.29 
 
 		 744 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  32.32 
 
 		 757 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  31.37 
 
 		 703 aa  269  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  32.12 
 
 		 725 aa  268  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  32.32 
 
 		 710 aa  268  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  33.33 
 
 		 650 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  31.16 
 
 		 710 aa  267  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  31.2 
 
 		 703 aa  267  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  32.19 
 
 		 750 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  32.19 
 
 		 757 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  30.95 
 
 		 781 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  31.27 
 
 		 672 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  31.09 
 
 		 781 aa  265  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  31.01 
 
 		 704 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  30.92 
 
 		 704 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  32.19 
 
 		 757 aa  264  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  32.19 
 
 		 757 aa  264  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  32.19 
 
 		 757 aa  264  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  32.19 
 
 		 757 aa  264  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  31.57 
 
 		 748 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  30.34 
 
 		 645 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  31.12 
 
 		 705 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  31.15 
 
 		 700 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  31.15 
 
 		 700 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  30.28 
 
 		 658 aa  263  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  31.49 
 
 		 705 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  30.85 
 
 		 814 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  30.77 
 
 		 702 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  30.91 
 
 		 706 aa  260  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  30.76 
 
 		 777 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  30.76 
 
 		 771 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  34.91 
 
 		 650 aa  256  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  30.23 
 
 		 776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  31.53 
 
 		 753 aa  255  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  30.45 
 
 		 674 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  32.76 
 
 		 804 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  31.83 
 
 		 736 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  30.41 
 
 		 791 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  29.89 
 
 		 758 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  30.33 
 
 		 803 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  29.72 
 
 		 783 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.1 
 
 		 641 aa  248  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  29.94 
 
 		 654 aa  246  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  29.8 
 
 		 650 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  29.8 
 
 		 654 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  29.92 
 
 		 803 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  29.22 
 
 		 662 aa  243  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  29.66 
 
 		 636 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  29.09 
 
 		 635 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  28.59 
 
 		 655 aa  228  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  28.46 
 
 		 696 aa  228  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  28.72 
 
 		 632 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  27.87 
 
 		 648 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  27.26 
 
 		 799 aa  219  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  28.12 
 
 		 660 aa  217  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  27.12 
 
 		 640 aa  217  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  32.28 
 
 		 714 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  26.97 
 
 		 640 aa  214  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  26.97 
 
 		 640 aa  214  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  26.81 
 
 		 892 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  33.2 
 
 		 584 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  32.6 
 
 		 584 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  26.22 
 
 		 904 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1043  general secretion pathway protein D  31.73 
 
 		 584 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  34.23 
 
 		 716 aa  181  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  25.94 
 
 		 902 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  26 
 
 		 897 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>