More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1518 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 772 aa  1546    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  48.3 
 
 		 756 aa  561  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  34.8 
 
 		 681 aa  329  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  33.08 
 
 		 780 aa  282  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  31.04 
 
 		 774 aa  258  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  29.76 
 
 		 733 aa  255  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  30.96 
 
 		 773 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  29.06 
 
 		 819 aa  252  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  30.96 
 
 		 767 aa  250  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  27.57 
 
 		 803 aa  246  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  28.47 
 
 		 775 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  28.3 
 
 		 775 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  29.9 
 
 		 751 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  28.67 
 
 		 801 aa  243  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  27.44 
 
 		 745 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  29.59 
 
 		 720 aa  243  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  28.87 
 
 		 763 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  28 
 
 		 829 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  35.21 
 
 		 833 aa  194  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  37.67 
 
 		 797 aa  187  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  33.33 
 
 		 794 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  36.45 
 
 		 779 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  37.34 
 
 		 686 aa  177  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  36.01 
 
 		 784 aa  173  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  35 
 
 		 751 aa  173  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  26.85 
 
 		 803 aa  172  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  26.37 
 
 		 807 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  23.99 
 
 		 641 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  26.2 
 
 		 783 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  25.95 
 
 		 783 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  33.89 
 
 		 766 aa  157  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  32.08 
 
 		 793 aa  157  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  25.5 
 
 		 781 aa  157  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  25.52 
 
 		 752 aa  156  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  26.16 
 
 		 789 aa  156  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  23.51 
 
 		 738 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  25.35 
 
 		 781 aa  154  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  26.75 
 
 		 728 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  25.79 
 
 		 750 aa  144  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  31.8 
 
 		 696 aa  144  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  25.33 
 
 		 717 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  24.64 
 
 		 793 aa  142  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  25.51 
 
 		 804 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  30.37 
 
 		 635 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  25.99 
 
 		 682 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  24.2 
 
 		 696 aa  137  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  25.73 
 
 		 803 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  30.98 
 
 		 630 aa  134  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  22.11 
 
 		 733 aa  134  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  25.37 
 
 		 803 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  24.12 
 
 		 753 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  22.76 
 
 		 636 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  27.79 
 
 		 904 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  27.63 
 
 		 902 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  31.01 
 
 		 744 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  31.15 
 
 		 716 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  27.22 
 
 		 799 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  30.99 
 
 		 660 aa  129  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  31.55 
 
 		 810 aa  128  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  22.19 
 
 		 648 aa  128  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  27.03 
 
 		 897 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  30.61 
 
 		 655 aa  126  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  24.64 
 
 		 814 aa  125  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  29.33 
 
 		 805 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  28.75 
 
 		 771 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  23.07 
 
 		 736 aa  122  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  29.21 
 
 		 711 aa  122  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  30.52 
 
 		 740 aa  121  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  24.06 
 
 		 748 aa  121  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  31.62 
 
 		 640 aa  121  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  33.21 
 
 		 787 aa  121  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  33.21 
 
 		 776 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  28.44 
 
 		 777 aa  120  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  28 
 
 		 787 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  34.72 
 
 		 758 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  31.88 
 
 		 714 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  28.53 
 
 		 750 aa  119  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  28.53 
 
 		 757 aa  119  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  28.53 
 
 		 757 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  28.53 
 
 		 757 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  28.53 
 
 		 757 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  28.53 
 
 		 757 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  28.67 
 
 		 640 aa  118  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  29.56 
 
 		 747 aa  118  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  28.67 
 
 		 640 aa  118  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  31.06 
 
 		 640 aa  118  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  26.67 
 
 		 892 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  32.47 
 
 		 748 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  26.98 
 
 		 757 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  28.33 
 
 		 640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  31.53 
 
 		 658 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  28.09 
 
 		 775 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  28.15 
 
 		 774 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  28.15 
 
 		 774 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  27.79 
 
 		 689 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  28.16 
 
 		 681 aa  114  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  29.91 
 
 		 774 aa  114  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  22.79 
 
 		 791 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  29.55 
 
 		 654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  29.55 
 
 		 654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>