More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3067 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 803 aa  1609    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  87.94 
 
 		 801 aa  1303    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  40.97 
 
 		 773 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  38.24 
 
 		 780 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  39.09 
 
 		 751 aa  466  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  37.82 
 
 		 774 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  35.11 
 
 		 779 aa  369  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  28.72 
 
 		 829 aa  272  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  29.56 
 
 		 745 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  27.77 
 
 		 819 aa  260  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  28.94 
 
 		 775 aa  257  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  28.55 
 
 		 775 aa  256  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  27.56 
 
 		 720 aa  252  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  28.68 
 
 		 733 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  28.16 
 
 		 681 aa  250  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  45.21 
 
 		 784 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  28.45 
 
 		 772 aa  243  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  41.34 
 
 		 805 aa  230  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  37.5 
 
 		 767 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  27.79 
 
 		 686 aa  201  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  37.09 
 
 		 797 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  35.22 
 
 		 794 aa  188  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  36.71 
 
 		 833 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  37.79 
 
 		 763 aa  170  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  36.39 
 
 		 776 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  35.64 
 
 		 756 aa  168  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  26.88 
 
 		 789 aa  162  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  32.81 
 
 		 793 aa  158  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  25.95 
 
 		 728 aa  157  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  32.56 
 
 		 751 aa  157  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  26.47 
 
 		 750 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  26.47 
 
 		 757 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  26.47 
 
 		 757 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  26.47 
 
 		 757 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  26.47 
 
 		 757 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  26.47 
 
 		 757 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  26.32 
 
 		 757 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  24.57 
 
 		 733 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  24.82 
 
 		 752 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  25.72 
 
 		 717 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  30 
 
 		 766 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  24.52 
 
 		 793 aa  142  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  23.72 
 
 		 696 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  25.51 
 
 		 777 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  28.89 
 
 		 711 aa  138  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  25.69 
 
 		 771 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  24.46 
 
 		 738 aa  134  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  24.29 
 
 		 689 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  24.22 
 
 		 736 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  26.23 
 
 		 814 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  26.22 
 
 		 703 aa  131  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  23.53 
 
 		 803 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  24.51 
 
 		 696 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  25.53 
 
 		 697 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  23.24 
 
 		 803 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.74 
 
 		 641 aa  127  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  24.58 
 
 		 799 aa  126  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  33.22 
 
 		 635 aa  126  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  24.54 
 
 		 807 aa  126  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  24.47 
 
 		 803 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  23.55 
 
 		 750 aa  124  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  23.75 
 
 		 681 aa  123  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  31.07 
 
 		 716 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  26.35 
 
 		 706 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  26.88 
 
 		 710 aa  122  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  26.35 
 
 		 704 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  27.35 
 
 		 662 aa  121  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  24.6 
 
 		 682 aa  121  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  25.59 
 
 		 791 aa  120  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  30.69 
 
 		 660 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  25.59 
 
 		 791 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  27.05 
 
 		 904 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  25.86 
 
 		 710 aa  119  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  27.39 
 
 		 781 aa  118  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  26.89 
 
 		 902 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  27.39 
 
 		 781 aa  117  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  30.23 
 
 		 702 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  26.54 
 
 		 704 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  32.23 
 
 		 630 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  26.15 
 
 		 705 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  26.31 
 
 		 702 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 		 705 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  26.99 
 
 		 700 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  26.99 
 
 		 700 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  26.35 
 
 		 703 aa  115  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  22.59 
 
 		 892 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  26.4 
 
 		 705 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  26.2 
 
 		 897 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  22.73 
 
 		 748 aa  115  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  29.71 
 
 		 655 aa  115  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  26.28 
 
 		 740 aa  114  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  28.43 
 
 		 747 aa  114  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  27.5 
 
 		 724 aa  114  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  25.89 
 
 		 650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  25.89 
 
 		 654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  26.1 
 
 		 654 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  30.1 
 
 		 640 aa  112  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  29.87 
 
 		 774 aa  112  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  30.38 
 
 		 787 aa  110  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  26.07 
 
 		 810 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>