More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1699 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  91.21 
 
 		 387 aa  724    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 387 aa  777    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12660  type II and III secretion system protein  37.43 
 
 		 385 aa  266  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1837  NolW domain-containing protein  28.39 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.403389  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  26.79 
 
 		 1421 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 602 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1256  secretin/TonB, short N-terminal domain  27.46 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  23.96 
 
 		 704 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0836  type II and III secretion system protein  26.34 
 
 		 1282 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934463  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  26.61 
 
 		 1282 aa  92.8  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  22.52 
 
 		 424 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1994  type II and III secretion system protein  21.63 
 
 		 499 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  26.26 
 
 		 413 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  21.18 
 
 		 718 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  21.19 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  22.85 
 
 		 711 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  27.81 
 
 		 653 aa  89.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  24.08 
 
 		 682 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  24.74 
 
 		 789 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  20.53 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  24.87 
 
 		 689 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  20.33 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  22.09 
 
 		 706 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 682 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  20.49 
 
 		 718 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  24.03 
 
 		 667 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  22.73 
 
 		 424 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  25.37 
 
 		 683 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  25.93 
 
 		 683 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  25.37 
 
 		 683 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  25.37 
 
 		 683 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  24.94 
 
 		 682 aa  86.3  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  21.95 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  25.49 
 
 		 683 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  22.03 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  21.88 
 
 		 717 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  26.6 
 
 		 684 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  22.03 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  22.03 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  24.39 
 
 		 580 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  26.43 
 
 		 684 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  23.33 
 
 		 656 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  23.59 
 
 		 668 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  23.08 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  22.8 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.13 
 
 		 874 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  26.11 
 
 		 684 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  26.44 
 
 		 812 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.86 
 
 		 684 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  20.29 
 
 		 692 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  22.39 
 
 		 870 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  21.77 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  21.77 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3590  type II and III secretion system protein  26.43 
 
 		 670 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  21.34 
 
 		 784 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  21.34 
 
 		 784 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  24.04 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1265  type II and III secretion system protein  32.24 
 
 		 1519 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00244048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  21.77 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  30.97 
 
 		 1302 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  25.18 
 
 		 683 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  21.17 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  22.63 
 
 		 714 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  23.17 
 
 		 717 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0618  type II and III secretion system protein  22.32 
 
 		 634 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00736959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  27.99 
 
 		 779 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  24.19 
 
 		 683 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  21.45 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  23.04 
 
 		 987 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  21.93 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  24.18 
 
 		 760 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  20.47 
 
 		 710 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.83 
 
 		 685 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  22.14 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  24.63 
 
 		 688 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  21.18 
 
 		 699 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  23.81 
 
 		 660 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  25.74 
 
 		 805 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  21.99 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  21.52 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  23.1 
 
 		 716 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1103  type II and III secretion system protein  19.39 
 
 		 655 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00448794  hitchhiker  0.000000000241277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  22.7 
 
 		 673 aa  76.6  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  24.57 
 
 		 756 aa  76.3  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  30.6 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  21.56 
 
 		 706 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  23.2 
 
 		 864 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  23.78 
 
 		 926 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  21.32 
 
 		 696 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  24.26 
 
 		 946 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  21.32 
 
 		 696 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  20.67 
 
 		 710 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  25.21 
 
 		 711 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  21.91 
 
 		 712 aa  74.7  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  22.75 
 
 		 734 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  25.06 
 
 		 547 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  21.63 
 
 		 721 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  23.84 
 
 		 710 aa  73.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  21.63 
 
 		 721 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  24.74 
 
 		 833 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>