More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0618 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0618  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 634 aa  1269    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00736959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1103  type II and III secretion system protein  36.07 
 
 		 655 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00448794  hitchhiker  0.000000000241277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3195  type II general secretion pathway (GSP) D protein  38.41 
 
 		 656 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  24.71 
 
 		 602 aa  161  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  26.6 
 
 		 882 aa  90.9  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  26.6 
 
 		 887 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  26.28 
 
 		 887 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0836  type II and III secretion system protein  25.12 
 
 		 1282 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934463  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  25.52 
 
 		 655 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  25.91 
 
 		 775 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  26.84 
 
 		 893 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  25.83 
 
 		 736 aa  83.6  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.47 
 
 		 894 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  23.45 
 
 		 387 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  26.28 
 
 		 787 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  25.94 
 
 		 744 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  24.2 
 
 		 926 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  25.12 
 
 		 1282 aa  80.9  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  27.33 
 
 		 640 aa  80.9  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  27.12 
 
 		 753 aa  80.9  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  22.74 
 
 		 944 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  22.32 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  24.56 
 
 		 946 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  23.17 
 
 		 719 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.82 
 
 		 874 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12660  type II and III secretion system protein  23.61 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  26.03 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  24.5 
 
 		 771 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  24.5 
 
 		 777 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  26.38 
 
 		 740 aa  77.4  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  25.93 
 
 		 682 aa  77.4  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  24.52 
 
 		 987 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  25.33 
 
 		 716 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.94 
 
 		 538 aa  76.6  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  25.16 
 
 		 372 aa  76.6  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  24.66 
 
 		 757 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  24.66 
 
 		 757 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  24.66 
 
 		 757 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  24.66 
 
 		 757 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  24.66 
 
 		 750 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  25.9 
 
 		 781 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  25.25 
 
 		 791 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  24.66 
 
 		 757 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  24.66 
 
 		 757 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  26.4 
 
 		 789 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  23.9 
 
 		 814 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  25.75 
 
 		 780 aa  75.5  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  24.54 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.1 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  26.67 
 
 		 729 aa  74.3  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  24.67 
 
 		 774 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  24.67 
 
 		 774 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  25.13 
 
 		 704 aa  74.3  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  25.99 
 
 		 635 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  25.25 
 
 		 780 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  25.91 
 
 		 728 aa  73.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  26.8 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  24.67 
 
 		 810 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  27.55 
 
 		 554 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  26.8 
 
 		 654 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  26.8 
 
 		 654 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  23.43 
 
 		 727 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  25.18 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  25.84 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  24.09 
 
 		 1421 aa  72  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  24.11 
 
 		 660 aa  72  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  25.62 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  27.43 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  26.46 
 
 		 714 aa  70.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  27.78 
 
 		 764 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  24.08 
 
 		 686 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  25.08 
 
 		 686 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  25.08 
 
 		 686 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  23.39 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  24.08 
 
 		 686 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  25.08 
 
 		 686 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  22.97 
 
 		 864 aa  70.5  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 717 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  27.03 
 
 		 783 aa  70.5  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0735  type II and III secretion system protein  23.99 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  25.86 
 
 		 702 aa  70.5  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  26.16 
 
 		 793 aa  70.1  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  26.07 
 
 		 689 aa  70.1  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  26.94 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  22.55 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  25.85 
 
 		 747 aa  68.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  25.61 
 
 		 630 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  23.81 
 
 		 723 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  24.63 
 
 		 779 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  25.25 
 
 		 805 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  23.79 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  25.94 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  24.83 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  23.6 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 807 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  25.68 
 
 		 625 aa  67.4  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  22.26 
 
 		 696 aa  67  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  28.42 
 
 		 423 aa  67  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  24.72 
 
 		 543 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  20.4 
 
 		 1302 aa  67  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>