More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1103 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1103  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 655 aa  1314    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00448794  hitchhiker  0.000000000241277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3195  type II general secretion pathway (GSP) D protein  47.18 
 
 		 656 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0618  type II and III secretion system protein  36.23 
 
 		 634 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00736959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  24.47 
 
 		 602 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  23.6 
 
 		 926 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  24.29 
 
 		 946 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  25.24 
 
 		 1421 aa  107  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.99 
 
 		 894 aa  104  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  24.34 
 
 		 870 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  22.57 
 
 		 944 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.12 
 
 		 706 aa  89.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  25.44 
 
 		 682 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  24.73 
 
 		 776 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  26.8 
 
 		 787 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.83 
 
 		 538 aa  87.8  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  22.76 
 
 		 689 aa  87.8  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  25.91 
 
 		 757 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  25.91 
 
 		 757 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  25.91 
 
 		 757 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  25.91 
 
 		 750 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  25.91 
 
 		 757 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  26.69 
 
 		 655 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  25.91 
 
 		 757 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  22.9 
 
 		 580 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  25.91 
 
 		 757 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12660  type II and III secretion system protein  21.47 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 763 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  21.6 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.6 
 
 		 874 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  22.65 
 
 		 698 aa  84  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  22.65 
 
 		 698 aa  84  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  20.63 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  22.73 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  23.26 
 
 		 729 aa  83.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  21.27 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  21.92 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  21.92 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  25.25 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  22 
 
 		 683 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  21.92 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  21.31 
 
 		 682 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  22.12 
 
 		 683 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  21.49 
 
 		 710 aa  80.9  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  20.21 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  22.12 
 
 		 683 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  23.26 
 
 		 696 aa  80.5  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  27.18 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  21.92 
 
 		 527 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  21.92 
 
 		 575 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  25.41 
 
 		 781 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  25.25 
 
 		 744 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  21.77 
 
 		 683 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  22.02 
 
 		 683 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  20.28 
 
 		 683 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  26.89 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  24.91 
 
 		 745 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  26.5 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  25.09 
 
 		 711 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  23.38 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  23.33 
 
 		 714 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  27.34 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  22.73 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  22.47 
 
 		 616 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  23.19 
 
 		 573 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  21.04 
 
 		 682 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  26.83 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  21.91 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  22.99 
 
 		 887 aa  77.8  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  21.09 
 
 		 882 aa  77.8  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  22.22 
 
 		 578 aa  77.4  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  21.07 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  24.5 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  25.44 
 
 		 733 aa  77.4  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  23.44 
 
 		 819 aa  77  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  21.07 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  23.87 
 
 		 791 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  24.36 
 
 		 814 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.26 
 
 		 567 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  22.99 
 
 		 887 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  21.78 
 
 		 685 aa  77  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  21.35 
 
 		 718 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  19.39 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  22.82 
 
 		 891 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  23.36 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  22.77 
 
 		 693 aa  75.5  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  24.42 
 
 		 740 aa  75.5  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  21.58 
 
 		 684 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  21.58 
 
 		 684 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  23.88 
 
 		 662 aa  75.1  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  24.01 
 
 		 810 aa  75.1  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  21.59 
 
 		 684 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  20.46 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  24.26 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  20.25 
 
 		 543 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  20.61 
 
 		 684 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  24.05 
 
 		 673 aa  75.1  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  21.48 
 
 		 718 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  24.09 
 
 		 764 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  25.58 
 
 		 771 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  23.81 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>