More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3195 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3195  type II general secretion pathway (GSP) D protein  100 
 
 		 656 aa  1323    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1103  type II and III secretion system protein  47.18 
 
 		 655 aa  585  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00448794  hitchhiker  0.000000000241277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0618  type II and III secretion system protein  38.41 
 
 		 634 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00736959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  21.45 
 
 		 602 aa  163  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  29.55 
 
 		 655 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  27.42 
 
 		 810 aa  99.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  24.33 
 
 		 944 aa  99.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  29.58 
 
 		 640 aa  97.1  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.88 
 
 		 894 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 716 aa  94.7  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  29.97 
 
 		 640 aa  94.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  26.67 
 
 		 740 aa  94.7  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  22.99 
 
 		 870 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  23.73 
 
 		 683 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  25.38 
 
 		 1421 aa  93.6  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  24.01 
 
 		 683 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  23.71 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  29.17 
 
 		 711 aa  92.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  24.01 
 
 		 683 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  24.01 
 
 		 683 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  24.01 
 
 		 683 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  24.53 
 
 		 684 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  24.07 
 
 		 580 aa  91.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  23.99 
 
 		 926 aa  91.3  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  24.47 
 
 		 698 aa  91.3  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  24.47 
 
 		 698 aa  91.3  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  29.14 
 
 		 819 aa  91.3  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  24.23 
 
 		 684 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  28.21 
 
 		 787 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  24.23 
 
 		 684 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.99 
 
 		 684 aa  89.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  27.02 
 
 		 649 aa  89  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  23.52 
 
 		 946 aa  89.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.58 
 
 		 706 aa  88.2  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  26.37 
 
 		 781 aa  88.2  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  27.55 
 
 		 640 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  28.37 
 
 		 682 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  27.69 
 
 		 774 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  27.55 
 
 		 640 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  27.69 
 
 		 774 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  27.55 
 
 		 640 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  23 
 
 		 711 aa  86.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  22.99 
 
 		 683 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.54 
 
 		 685 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  28.47 
 
 		 673 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  25.18 
 
 		 915 aa  85.1  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  23 
 
 		 689 aa  85.1  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  27.48 
 
 		 789 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  28.1 
 
 		 904 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  22.32 
 
 		 706 aa  84.7  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  27.36 
 
 		 775 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  24.3 
 
 		 693 aa  84  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  26.89 
 
 		 650 aa  84  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  27.33 
 
 		 781 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.08 
 
 		 538 aa  84  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 		 757 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  25.68 
 
 		 781 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 		 757 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 		 757 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 		 750 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 		 757 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 		 757 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 		 757 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  21.36 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  28.81 
 
 		 714 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  27.33 
 
 		 902 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.57 
 
 		 874 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  22.4 
 
 		 682 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  27.67 
 
 		 829 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 763 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  27.45 
 
 		 791 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  22.72 
 
 		 682 aa  82  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  24.65 
 
 		 784 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  23.02 
 
 		 714 aa  81.6  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  24.07 
 
 		 578 aa  81.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  21.59 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  26.57 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  27.41 
 
 		 814 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  23.26 
 
 		 538 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  25.75 
 
 		 655 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  27.06 
 
 		 897 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  22.3 
 
 		 420 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  21.98 
 
 		 413 aa  80.1  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  27.27 
 
 		 771 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  26.48 
 
 		 506 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  22.13 
 
 		 543 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  27.39 
 
 		 563 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  20.87 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  25.76 
 
 		 660 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  25.76 
 
 		 702 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  21.82 
 
 		 710 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  26.52 
 
 		 780 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  27.12 
 
 		 777 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  22.41 
 
 		 704 aa  79.7  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  27.7 
 
 		 776 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  28.62 
 
 		 660 aa  79  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  26.73 
 
 		 744 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  24.66 
 
 		 653 aa  79  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  22.69 
 
 		 688 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  24.84 
 
 		 793 aa  79  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>