More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0078 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 660 aa  1323    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  26.58 
 
 		 740 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  26.97 
 
 		 783 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  26.83 
 
 		 728 aa  197  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  27.87 
 
 		 738 aa  195  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  25.62 
 
 		 793 aa  193  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  28.01 
 
 		 747 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  27.8 
 
 		 641 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  28.05 
 
 		 736 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  27.29 
 
 		 702 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  26.61 
 
 		 807 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  26.27 
 
 		 781 aa  177  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  24.44 
 
 		 799 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  26.47 
 
 		 781 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  27.06 
 
 		 717 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  25.83 
 
 		 803 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  26.07 
 
 		 753 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  26.95 
 
 		 805 aa  171  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  23.14 
 
 		 673 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  23.86 
 
 		 783 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  26.19 
 
 		 635 aa  167  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  26.38 
 
 		 630 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  27.34 
 
 		 648 aa  165  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 750 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  24.2 
 
 		 655 aa  160  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  24.96 
 
 		 789 aa  160  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  24.96 
 
 		 666 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  26.25 
 
 		 787 aa  160  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  26.3 
 
 		 636 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  23.06 
 
 		 670 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  23.3 
 
 		 892 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  24.96 
 
 		 776 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  24.69 
 
 		 703 aa  152  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  25.64 
 
 		 632 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  27.02 
 
 		 660 aa  150  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  24.71 
 
 		 650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  25.48 
 
 		 645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  26.92 
 
 		 725 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  24.56 
 
 		 654 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  24.56 
 
 		 654 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  25.53 
 
 		 748 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  24.48 
 
 		 758 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  30.79 
 
 		 810 aa  145  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  24.02 
 
 		 672 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2608  general secretion pathway protein D  23.58 
 
 		 842 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  25.04 
 
 		 649 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  32.73 
 
 		 771 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  32.73 
 
 		 777 aa  142  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  31.47 
 
 		 787 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  34.04 
 
 		 774 aa  140  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  24.32 
 
 		 650 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  24.88 
 
 		 658 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  23.03 
 
 		 697 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  30.06 
 
 		 804 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  28.14 
 
 		 803 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  25.45 
 
 		 780 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  29.75 
 
 		 819 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  23.13 
 
 		 658 aa  135  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  24.88 
 
 		 658 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  20.73 
 
 		 650 aa  134  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  30.51 
 
 		 682 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  33.76 
 
 		 744 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  28.14 
 
 		 803 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  31.76 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  31.76 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  31.76 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  31.76 
 
 		 750 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  31.76 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  31.76 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  31.13 
 
 		 757 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  24.72 
 
 		 634 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  24.01 
 
 		 655 aa  130  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  31.1 
 
 		 781 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  24.4 
 
 		 640 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  23.05 
 
 		 745 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  33 
 
 		 987 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  24.26 
 
 		 704 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  24.29 
 
 		 702 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  30.77 
 
 		 775 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  23.91 
 
 		 704 aa  126  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  22.62 
 
 		 904 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  22.7 
 
 		 902 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  23.98 
 
 		 662 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  31.51 
 
 		 774 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  24.49 
 
 		 700 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  24.49 
 
 		 700 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  23.04 
 
 		 751 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  31.51 
 
 		 774 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  24.61 
 
 		 705 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  22.69 
 
 		 897 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  24.69 
 
 		 706 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  23.22 
 
 		 767 aa  124  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 703 aa  124  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  23.75 
 
 		 640 aa  124  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  23.97 
 
 		 703 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  24.15 
 
 		 705 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  32.81 
 
 		 814 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  28.81 
 
 		 569 aa  120  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  28.22 
 
 		 720 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  29.97 
 
 		 829 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>