More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1406 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 538 aa  1100    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1791  type II and III secretion system protein  37.52 
 
 		 524 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.561359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1027  type II and III secretion system protein  37.55 
 
 		 552 aa  297  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40658 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1994  type II and III secretion system protein  31.13 
 
 		 499 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  32.59 
 
 		 893 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  34.26 
 
 		 887 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  34.26 
 
 		 887 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  34.03 
 
 		 882 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  31.03 
 
 		 894 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  31.41 
 
 		 718 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  31.41 
 
 		 718 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  30.7 
 
 		 668 aa  200  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  33.25 
 
 		 944 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  32.62 
 
 		 870 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  30.77 
 
 		 729 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.91 
 
 		 698 aa  191  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.91 
 
 		 698 aa  190  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  30.37 
 
 		 692 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.65 
 
 		 874 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  29.2 
 
 		 717 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  29.25 
 
 		 710 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  31.69 
 
 		 864 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  30.7 
 
 		 553 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  30.89 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  31.9 
 
 		 926 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  30.3 
 
 		 987 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  30.68 
 
 		 543 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  29.52 
 
 		 706 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  30.47 
 
 		 553 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  31.59 
 
 		 543 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  30.26 
 
 		 714 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  31.84 
 
 		 1269 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  31.59 
 
 		 946 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  29.91 
 
 		 523 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  29.87 
 
 		 721 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  29.12 
 
 		 714 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  29.87 
 
 		 721 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  30.91 
 
 		 591 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  30.75 
 
 		 567 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  30.33 
 
 		 683 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  30.99 
 
 		 616 aa  180  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  30.33 
 
 		 683 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  30.99 
 
 		 575 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  30.99 
 
 		 462 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  30.33 
 
 		 683 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  30.99 
 
 		 462 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  30.99 
 
 		 462 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  30.99 
 
 		 465 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  30.99 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  28.51 
 
 		 710 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  30.4 
 
 		 682 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  30.33 
 
 		 683 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  30.12 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  30.57 
 
 		 684 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  30.4 
 
 		 684 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  29.53 
 
 		 547 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  29.92 
 
 		 784 aa  178  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  29.92 
 
 		 784 aa  178  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  29.02 
 
 		 704 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  29.38 
 
 		 580 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  30.4 
 
 		 576 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  30.33 
 
 		 684 aa  176  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  29.68 
 
 		 808 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  30.33 
 
 		 684 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  30.17 
 
 		 891 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  30.3 
 
 		 717 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.48 
 
 		 706 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  29.31 
 
 		 683 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  29.86 
 
 		 573 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  27.17 
 
 		 706 aa  171  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  29.22 
 
 		 683 aa  171  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  29.22 
 
 		 682 aa  171  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  28.81 
 
 		 688 aa  171  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0735  type II and III secretion system protein  29.28 
 
 		 509 aa  169  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  26.35 
 
 		 723 aa  169  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  27.87 
 
 		 721 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  29.38 
 
 		 685 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  29.8 
 
 		 716 aa  167  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  29.22 
 
 		 683 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  28.31 
 
 		 694 aa  166  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  29.86 
 
 		 712 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  28.41 
 
 		 710 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  27.97 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  28.37 
 
 		 433 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  28.27 
 
 		 420 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  28.85 
 
 		 714 aa  163  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  28.5 
 
 		 420 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  29.22 
 
 		 682 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0540  type IV pilus secretin PilQ  29.79 
 
 		 636 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.614076  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  27.51 
 
 		 711 aa  160  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  27.33 
 
 		 712 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  27.53 
 
 		 727 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  29.49 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  26.77 
 
 		 715 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  26.72 
 
 		 689 aa  157  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  28.77 
 
 		 412 aa  157  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  27.49 
 
 		 422 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  29.49 
 
 		 500 aa  156  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  29.64 
 
 		 458 aa  156  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  28.21 
 
 		 696 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>