More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12660 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_12660  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 385 aa  768    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  37.43 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  37.11 
 
 		 387 aa  259  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1837  NolW domain-containing protein  30.53 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.403389  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1256  secretin/TonB, short N-terminal domain  27.89 
 
 		 369 aa  119  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  27.03 
 
 		 602 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  26.58 
 
 		 1421 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  23.59 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1994  type II and III secretion system protein  23 
 
 		 499 aa  93.6  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  23.59 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  24.2 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  22.96 
 
 		 944 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  23.44 
 
 		 420 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  26.2 
 
 		 881 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  24.23 
 
 		 704 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.25 
 
 		 874 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  23.74 
 
 		 870 aa  86.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1103  type II and III secretion system protein  21.26 
 
 		 655 aa  86.3  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00448794  hitchhiker  0.000000000241277 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  23.66 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  22.56 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  24.19 
 
 		 670 aa  84.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  23.74 
 
 		 698 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  23.74 
 
 		 698 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  25.87 
 
 		 745 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  22.25 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  31.44 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  23.18 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  26.62 
 
 		 780 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 689 aa  80.1  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  28.09 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  29.76 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0618  type II and III secretion system protein  23.61 
 
 		 634 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00736959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  25.53 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  28.02 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  25.75 
 
 		 662 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  26.16 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  21.82 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  24.56 
 
 		 1269 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  23.68 
 
 		 926 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  29.76 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  24.78 
 
 		 630 aa  77  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  22.97 
 
 		 712 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  24.83 
 
 		 636 aa  77  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  22.03 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  24.37 
 
 		 776 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  25.62 
 
 		 569 aa  76.6  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  25.94 
 
 		 763 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  24.15 
 
 		 683 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  24.62 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  24.15 
 
 		 683 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  24 
 
 		 699 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 538 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  25.44 
 
 		 779 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  23.2 
 
 		 640 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  25.64 
 
 		 696 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  24.15 
 
 		 683 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  22.74 
 
 		 567 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  24.15 
 
 		 683 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  24.73 
 
 		 784 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  23.62 
 
 		 946 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  21.91 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  22.14 
 
 		 591 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  25.61 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  26.03 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  23.52 
 
 		 578 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  24.13 
 
 		 667 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  23.2 
 
 		 640 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  23.2 
 
 		 640 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  23.32 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  23.48 
 
 		 682 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  21.36 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  31.55 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1907  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  23.53 
 
 		 691 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  21.98 
 
 		 553 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  21.5 
 
 		 543 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  30 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  24.1 
 
 		 547 aa  72.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  24.27 
 
 		 683 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  25.1 
 
 		 630 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  22.54 
 
 		 668 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  25.82 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  25.1 
 
 		 635 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  25.09 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  24.07 
 
 		 660 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.7 
 
 		 894 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  21.52 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  21.52 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  29.83 
 
 		 784 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  21.52 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  29.83 
 
 		 784 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  22.37 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  25.31 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  25.2 
 
 		 719 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  21.52 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  24.58 
 
 		 717 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  24.64 
 
 		 682 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  23.64 
 
 		 833 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  22.82 
 
 		 710 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>