59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1256 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1256  secretin/TonB, short N-terminal domain  100 
 
 		 369 aa  727    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  28.61 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12660  type II and III secretion system protein  27.4 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1837  NolW domain-containing protein  28.39 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.403389  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  27.17 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  21.81 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  22.5 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  21.92 
 
 		 1421 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  24.54 
 
 		 686 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1255  hypothetical protein  41.18 
 
 		 428 aa  57  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0409197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  24.87 
 
 		 779 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  27.81 
 
 		 891 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1729  type II and III secretion system protein  22.78 
 
 		 673 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514108  normal  0.0788393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  21.83 
 
 		 793 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  29.82 
 
 		 915 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3917  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  23.18 
 
 		 505 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3830  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  23.18 
 
 		 505 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0474  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  21.2 
 
 		 683 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  25.18 
 
 		 635 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  23.21 
 
 		 803 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  18.29 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4118  type II and III secretion system protein  21.43 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000089242 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  22.03 
 
 		 750 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1211  type II and III secretion system protein  23.06 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  23.3 
 
 		 803 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  19 
 
 		 874 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  21.62 
 
 		 525 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  28.24 
 
 		 1302 aa  46.6  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  25.47 
 
 		 460 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  18.64 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  23.65 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  25.47 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  34.43 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  18.64 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  22.59 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0190  type II and III secretion system protein  22.54 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  22.8 
 
 		 791 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  25.47 
 
 		 460 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2743  type II and III secretion system protein  21.05 
 
 		 509 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.230673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  20.8 
 
 		 733 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1265  type II and III secretion system protein  28.96 
 
 		 1519 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00244048  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  21.59 
 
 		 499 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  22.85 
 
 		 502 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  20.51 
 
 		 696 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  18.32 
 
 		 1269 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  23.58 
 
 		 464 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  23.46 
 
 		 1282 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  23.83 
 
 		 436 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  29.59 
 
 		 881 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  23.9 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  18.65 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  18.98 
 
 		 412 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42350  Type III secretion outer membrane protein PscC precursor  19.5 
 
 		 600 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2249  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  21.71 
 
 		 491 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570406  normal  0.0166215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  18.98 
 
 		 412 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  20.43 
 
 		 716 aa  42.7  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  23.91 
 
 		 783 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  30 
 
 		 791 aa  42.7  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0094  hypothetical protein  24.86 
 
 		 448 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>