More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0474 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0474  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  100 
 
 
683 aa  1360    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03393  HrpA type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  32.33 
 
 
591 aa  295  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5918  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  34.78 
 
 
588 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033473  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2165  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  36.2 
 
 
599 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0648  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  36.4 
 
 
601 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778085  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1987  type II/III secretion system protein  36.2 
 
 
599 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76891  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1602  type II/III secretion system protein  36.2 
 
 
599 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0044992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0666  type II/III secretion system protein  36.2 
 
 
599 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2249  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  36.22 
 
 
601 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5871  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  33.21 
 
 
561 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5654  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  33.69 
 
 
589 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.0207457 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0418  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  31.65 
 
 
630 aa  267  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17202  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0874  Hrp conserved HRCC transmembrane protein  31.87 
 
 
568 aa  267  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.23962  normal  0.0136899 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1893  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  31.46 
 
 
588 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3741  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  29.64 
 
 
678 aa  265  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452401  normal  0.0121623 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1985  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  31.05 
 
 
588 aa  264  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3132  putative type III secretion hypersensitivity response secretion protein, HrcC/HrpA1- like  34.2 
 
 
736 aa  263  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15642  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3512  Type III secretion system outer membrane pore YscC/HrcC  29.27 
 
 
681 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4854  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  29.27 
 
 
681 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4751  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  29.3 
 
 
680 aa  261  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5430  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  29.27 
 
 
681 aa  261  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128772  normal  0.061937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4228  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  29.32 
 
 
681 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5220  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  34.85 
 
 
637 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0054  type III secretion outer membrane pore YscC  33.71 
 
 
612 aa  254  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003337  type III secretion system outer membrane pore YscC  30.02 
 
 
604 aa  230  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2997  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  29.91 
 
 
624 aa  216  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3830  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  30.31 
 
 
505 aa  213  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3917  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  30.31 
 
 
505 aa  213  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01700  hypothetical protein  29.83 
 
 
623 aa  210  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42350  Type III secretion outer membrane protein PscC precursor  31.31 
 
 
600 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2249  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  30.49 
 
 
491 aa  190  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570406  normal  0.0166215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5069  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  28.32 
 
 
512 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1907  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  27.73 
 
 
691 aa  187  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1946  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  29.87 
 
 
491 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2192  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  27.96 
 
 
689 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0179  type III secretion outer membrane protein MxiD  28.68 
 
 
566 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0824989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2175  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  30.32 
 
 
617 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3088  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  28.54 
 
 
556 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.994223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3051  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  28.54 
 
 
514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3103  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  28.34 
 
 
514 aa  174  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000610588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3208  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  28.34 
 
 
514 aa  174  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166938  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3020  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  28.34 
 
 
514 aa  174  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1200  outer-membrane type III secretion protein HrcC  28.55 
 
 
700 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0023  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.22 
 
 
696 aa  172  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0828  type III secretion system protein BsaO  29.11 
 
 
619 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0276407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2426  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  37.45 
 
 
666 aa  166  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1389  outer-membrane type III secretion protein HrcC  26.62 
 
 
699 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1544  type III secretion system protein BsaO  28.57 
 
 
606 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2060  type III secretion system protein BsaO  28.57 
 
 
625 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462668  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0740  type III secretion system protein BsaO  28.57 
 
 
625 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.513099  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4149  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.6 
 
 
567 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0153519 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2087  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  28.17 
 
 
625 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1948  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.79 
 
 
497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.118723 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1506  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.79 
 
 
497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1491  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.79 
 
 
497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1528  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.99 
 
 
497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.633101  normal  0.0399661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1778  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.79 
 
 
497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0371241  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0777  type II/III secretion system protein  39.89 
 
 
605 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0586  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  33.07 
 
 
339 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000694626  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5868  type II/III secretion system family protein  29.17 
 
 
475 aa  119  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231603  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5651  NolW domain-containing protein  28.94 
 
 
446 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0288442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  29.56 
 
 
891 aa  111  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  28.79 
 
 
422 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  28.81 
 
 
829 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  28.57 
 
 
420 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  28.25 
 
 
420 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  26.02 
 
 
819 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  28.2 
 
 
420 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  25.82 
 
 
745 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  27.05 
 
 
729 aa  100  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  29.41 
 
 
1421 aa  100  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  29.24 
 
 
710 aa  96.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  28.62 
 
 
711 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  26.49 
 
 
538 aa  95.5  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  28.23 
 
 
660 aa  94.7  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  27.78 
 
 
926 aa  94.7  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  26.09 
 
 
692 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  26.3 
 
 
763 aa  94  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  26.45 
 
 
717 aa  94  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  27.74 
 
 
720 aa  94  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  27.22 
 
 
706 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  27.94 
 
 
870 aa  93.6  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  27.94 
 
 
944 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.33 
 
 
718 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  27.5 
 
 
706 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  29.1 
 
 
797 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  28.01 
 
 
721 aa  91.3  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5921  type II/III secretion system family protein  24.76 
 
 
511 aa  90.9  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0561262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  28.01 
 
 
721 aa  90.9  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  24.62 
 
 
349 aa  90.9  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  26.48 
 
 
698 aa  90.9  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  26.48 
 
 
698 aa  90.9  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  27.68 
 
 
894 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  27.3 
 
 
714 aa  90.1  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  27.11 
 
 
776 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  26.67 
 
 
946 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  27.34 
 
 
426 aa  90.1  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  26.32 
 
 
668 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  29.24 
 
 
794 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  26.3 
 
 
372 aa  89.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>