More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2175 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2175  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  100 
 
 
617 aa  1236    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2060  type III secretion system protein BsaO  97.76 
 
 
625 aa  1115    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462668  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1544  type III secretion system protein BsaO  97.58 
 
 
606 aa  1098    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0586  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  100 
 
 
339 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000694626  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0828  type III secretion system protein BsaO  93.55 
 
 
619 aa  1057    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0276407  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2087  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  97.76 
 
 
625 aa  1114    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0740  type III secretion system protein BsaO  97.76 
 
 
625 aa  1115    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.513099  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0585  Type III secretion system protein  99.22 
 
 
993 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00011059  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3088  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  43.33 
 
 
556 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.994223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3051  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  43.6 
 
 
514 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3208  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  43.6 
 
 
514 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166938  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3020  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  43.6 
 
 
514 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3103  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  43.6 
 
 
514 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000610588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4149  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  40.87 
 
 
567 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0153519 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0179  type III secretion outer membrane protein MxiD  37.43 
 
 
566 aa  365  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0824989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003337  type III secretion system outer membrane pore YscC  29.89 
 
 
604 aa  233  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01700  hypothetical protein  30.48 
 
 
623 aa  228  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0054  type III secretion outer membrane pore YscC  29.36 
 
 
612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42350  Type III secretion outer membrane protein PscC precursor  28.62 
 
 
600 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0874  Hrp conserved HRCC transmembrane protein  28.67 
 
 
568 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.23962  normal  0.0136899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3917  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.88 
 
 
505 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3830  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.88 
 
 
505 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1985  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  28.23 
 
 
588 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1893  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  28.23 
 
 
588 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0418  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.49 
 
 
630 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03393  HrpA type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  28.6 
 
 
591 aa  187  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0474  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  29.72 
 
 
683 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5918  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  28.25 
 
 
588 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033473  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0777  type II/III secretion system protein  28.21 
 
 
605 aa  160  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296744  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2165  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.49 
 
 
599 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1389  outer-membrane type III secretion protein HrcC  29.18 
 
 
699 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1602  type II/III secretion system protein  27.57 
 
 
599 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0044992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1987  type II/III secretion system protein  27.57 
 
 
599 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76891  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0666  type II/III secretion system protein  27.57 
 
 
599 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4228  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  26.9 
 
 
681 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2249  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  28.99 
 
 
491 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570406  normal  0.0166215 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4751  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.41 
 
 
680 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1946  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  28.99 
 
 
491 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5069  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  33.33 
 
 
512 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240332 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0648  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.39 
 
 
601 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778085  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2249  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.39 
 
 
601 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1506  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  27.46 
 
 
497 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1948  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  27.46 
 
 
497 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.118723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1491  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  27.46 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1778  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  27.46 
 
 
497 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0371241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1528  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  27.46 
 
 
497 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.633101  normal  0.0399661 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5654  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  29.14 
 
 
589 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.0207457 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5871  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  29.09 
 
 
561 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2426  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  25.88 
 
 
666 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2997  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.9 
 
 
624 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3512  Type III secretion system outer membrane pore YscC/HrcC  25.79 
 
 
681 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4854  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  25.79 
 
 
681 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5430  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  25.79 
 
 
681 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128772  normal  0.061937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0023  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.85 
 
 
696 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3741  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  26.35 
 
 
678 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452401  normal  0.0121623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1907  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.79 
 
 
691 aa  143  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1200  outer-membrane type III secretion protein HrcC  27.77 
 
 
700 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3132  putative type III secretion hypersensitivity response secretion protein, HrcC/HrpA1- like  27.36 
 
 
736 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15642  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2192  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  25.93 
 
 
689 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5220  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  27.38 
 
 
637 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  25.6 
 
 
696 aa  89  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  24.2 
 
 
740 aa  78.2  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4118  type II and III secretion system protein  23.55 
 
 
393 aa  77  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000089242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  26.21 
 
 
753 aa  75.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  23.3 
 
 
738 aa  73.9  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  22.87 
 
 
655 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  21.77 
 
 
660 aa  72.4  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  24.84 
 
 
781 aa  72  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  22.41 
 
 
750 aa  72  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  20.45 
 
 
640 aa  71.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  22.4 
 
 
810 aa  71.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  24.48 
 
 
702 aa  71.6  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  20.45 
 
 
640 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  20.45 
 
 
640 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  24.84 
 
 
781 aa  71.2  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5868  type II/III secretion system family protein  25.08 
 
 
475 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231603  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5651  NolW domain-containing protein  24.52 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0288442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  25 
 
 
787 aa  70.5  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  23.72 
 
 
689 aa  69.3  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  22.7 
 
 
745 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  23.08 
 
 
805 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  23.84 
 
 
774 aa  67  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  22.77 
 
 
747 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  24.54 
 
 
944 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  24.91 
 
 
670 aa  66.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  21.85 
 
 
424 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  23.32 
 
 
486 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  23.44 
 
 
926 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  23.33 
 
 
775 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  23.1 
 
 
660 aa  65.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  23.77 
 
 
602 aa  65.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  23.81 
 
 
946 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  20.94 
 
 
1421 aa  65.1  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  23.81 
 
 
777 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  24.68 
 
 
804 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  23.81 
 
 
771 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  21.85 
 
 
424 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  21.52 
 
 
681 aa  64.3  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  22.35 
 
 
690 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  23.17 
 
 
783 aa  64.3  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>