69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0585 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0741  type III secretion system protein BsaP  100 
 
 		 373 aa  715    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1543  type III secretion system protein BsaP  100 
 
 		 373 aa  715    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2061  type III secretion system protein BsaP  100 
 
 		 373 aa  715    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.760678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0829  type III secretion system protein BsaP  93.6 
 
 		 408 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00319367  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2174  type III secretion regulator YopN/LcrE/InvE/MxiC  99.73 
 
 		 373 aa  713    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2086  type III secretion regulator YopN/LcrE/InvE/MxiC  100 
 
 		 373 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350134  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0585  Type III secretion system protein  100 
 
 		 993 aa  1906    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00011059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2175  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  97.89 
 
 		 617 aa  476  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2087  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  97.92 
 
 		 625 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2060  type III secretion system protein BsaO  97.23 
 
 		 625 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462668  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0740  type III secretion system protein BsaO  97.23 
 
 		 625 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.513099  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1544  type III secretion system protein BsaO  96.69 
 
 		 606 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0828  type III secretion system protein BsaO  94.78 
 
 		 619 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0276407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3088  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  39.91 
 
 		 556 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.994223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3020  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  39.34 
 
 		 514 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3051  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  39.34 
 
 		 514 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3208  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  39.34 
 
 		 514 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3103  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  39.34 
 
 		 514 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000610588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4149  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  41.36 
 
 		 567 aa  152  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0153519 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0180  MxiC  32.68 
 
 		 355 aa  149  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245404  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0179  type III secretion outer membrane protein MxiD  35.08 
 
 		 566 aa  144  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0824989  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3102  invasion protein InvE  34.66 
 
 		 372 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3087  invasion protein InvE  34.66 
 
 		 372 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3050  invasion protein InvE  34.66 
 
 		 372 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0962519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3019  invasion protein InvE  34.66 
 
 		 372 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3207  invasion protein InvE  34.66 
 
 		 372 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0861003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01700  hypothetical protein  27.61 
 
 		 623 aa  102  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003337  type III secretion system outer membrane pore YscC  25.56 
 
 		 604 aa  96.3  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4148  EivE  27.09 
 
 		 381 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0125216 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0054  type III secretion outer membrane pore YscC  30.04 
 
 		 612 aa  93.2  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42350  Type III secretion outer membrane protein PscC precursor  27.49 
 
 		 600 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0777  type II/III secretion system protein  32 
 
 		 605 aa  92.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03393  HrpA type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  32.79 
 
 		 591 aa  92  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1893  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  30.05 
 
 		 588 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0418  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  30.05 
 
 		 630 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17202  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1985  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  30.05 
 
 		 588 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0648  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  30.67 
 
 		 601 aa  84.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778085  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2249  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  30.67 
 
 		 601 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1602  type II/III secretion system protein  30.67 
 
 		 599 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0044992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1987  type II/III secretion system protein  30.67 
 
 		 599 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76891  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0666  type II/III secretion system protein  30.67 
 
 		 599 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2165  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  30.67 
 
 		 599 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5918  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  32.67 
 
 		 588 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033473  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0874  Hrp conserved HRCC transmembrane protein  28.78 
 
 		 568 aa  82  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.23962  normal  0.0136899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0474  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  32.43 
 
 		 683 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5871  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  33.55 
 
 		 561 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5654  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  33.55 
 
 		 589 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.0207457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5069  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  24.74 
 
 		 512 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.240332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3917  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  25.76 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3830  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  25.76 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5868  type II/III secretion system family protein  27.62 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5651  NolW domain-containing protein  27.62 
 
 		 446 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0288442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2249  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  25.41 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570406  normal  0.0166215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1946  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  25.41 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5921  type II/III secretion system family protein  28.65 
 
 		 511 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0561262 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2997  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  23.61 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2426  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  25.69 
 
 		 666 aa  57.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5220  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  28.92 
 
 		 637 aa  55.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5430  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.6 
 
 		 681 aa  54.7  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128772  normal  0.061937 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3512  Type III secretion system outer membrane pore YscC/HrcC  24.6 
 
 		 681 aa  54.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4854  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.6 
 
 		 681 aa  54.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3132  putative type III secretion hypersensitivity response secretion protein, HrcC/HrpA1- like  26.85 
 
 		 736 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15642  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4228  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.06 
 
 		 681 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4751  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.06 
 
 		 680 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3741  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  25.33 
 
 		 678 aa  50.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452401  normal  0.0121623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0023  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  26.39 
 
 		 696 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2419  type III secretion regulator YopN/LcrE/InvE/MxiC  27.34 
 
 		 379 aa  49.3  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1200  outer-membrane type III secretion protein HrcC  26.67 
 
 		 700 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_002620  TC0364  type III secreted protein SctW  19.69 
 
 		 418 aa  45.8  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0863411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>