More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1602 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1602  type II/III secretion system protein  100 
 
 
599 aa  1209    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0044992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0648  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  98.67 
 
 
601 aa  1102    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778085  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1987  type II/III secretion system protein  100 
 
 
599 aa  1209    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76891  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2249  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  99.17 
 
 
601 aa  1107    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2165  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  99.83 
 
 
599 aa  1203    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0777  type II/III secretion system protein  92.89 
 
 
605 aa  1039    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296744  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0666  type II/III secretion system protein  100 
 
 
599 aa  1209    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5918  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  53.91 
 
 
588 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033473  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1985  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  50 
 
 
588 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1893  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  50 
 
 
588 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0418  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  49.84 
 
 
630 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17202  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5654  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  55.77 
 
 
589 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.0207457 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5871  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  55.5 
 
 
561 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03393  HrpA type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  46.45 
 
 
591 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0874  Hrp conserved HRCC transmembrane protein  43.83 
 
 
568 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.23962  normal  0.0136899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4751  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  38.88 
 
 
680 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4228  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  38.88 
 
 
681 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5430  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  38.12 
 
 
681 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128772  normal  0.061937 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3512  Type III secretion system outer membrane pore YscC/HrcC  38.12 
 
 
681 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4854  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  38.12 
 
 
681 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3741  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  38.39 
 
 
678 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452401  normal  0.0121623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0474  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  36.65 
 
 
683 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3132  putative type III secretion hypersensitivity response secretion protein, HrcC/HrpA1- like  34.43 
 
 
736 aa  287  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15642  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5220  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  32.88 
 
 
637 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2997  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  29.98 
 
 
624 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1389  outer-membrane type III secretion protein HrcC  25.5 
 
 
699 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3051  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.73 
 
 
514 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3088  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.73 
 
 
556 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.994223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2192  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  27.04 
 
 
689 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3208  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.73 
 
 
514 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166938  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3020  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.73 
 
 
514 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3103  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.73 
 
 
514 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000610588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0023  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  26.38 
 
 
696 aa  185  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3830  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  36.42 
 
 
505 aa  183  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3917  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  36.42 
 
 
505 aa  183  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2175  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.94 
 
 
617 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1907  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.08 
 
 
691 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4149  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  25.49 
 
 
567 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0153519 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2060  type III secretion system protein BsaO  27.39 
 
 
625 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462668  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1544  type III secretion system protein BsaO  27.39 
 
 
606 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2087  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.39 
 
 
625 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0740  type III secretion system protein BsaO  27.39 
 
 
625 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.513099  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0828  type III secretion system protein BsaO  27.02 
 
 
619 aa  171  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0276407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2426  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  33.9 
 
 
666 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0179  type III secretion outer membrane protein MxiD  25.26 
 
 
566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0824989  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1506  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  34.22 
 
 
497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1948  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  34.22 
 
 
497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.118723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1491  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  34.22 
 
 
497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1528  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  34.33 
 
 
497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.633101  normal  0.0399661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1778  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  34.22 
 
 
497 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0371241  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1946  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  36.67 
 
 
491 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2249  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  36.33 
 
 
491 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570406  normal  0.0166215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5069  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  30.54 
 
 
512 aa  157  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240332 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0054  type III secretion outer membrane pore YscC  32.67 
 
 
612 aa  157  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42350  Type III secretion outer membrane protein PscC precursor  33.54 
 
 
600 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003337  type III secretion system outer membrane pore YscC  32.53 
 
 
604 aa  145  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5868  type II/III secretion system family protein  40.22 
 
 
475 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231603  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5651  NolW domain-containing protein  39.89 
 
 
446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0288442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01700  hypothetical protein  33.33 
 
 
623 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1200  outer-membrane type III secretion protein HrcC  31.58 
 
 
700 aa  123  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5921  type II/III secretion system family protein  34.65 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0561262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  29.73 
 
 
538 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  29.93 
 
 
887 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  29.93 
 
 
887 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  30.16 
 
 
784 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  30.16 
 
 
784 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  30.07 
 
 
523 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  28.97 
 
 
714 aa  112  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  29.83 
 
 
893 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  29.59 
 
 
882 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0586  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  28.31 
 
 
339 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000694626  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  29.31 
 
 
721 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  28.04 
 
 
710 aa  108  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  29.31 
 
 
721 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  30.9 
 
 
616 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  30.53 
 
 
567 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  28.7 
 
 
710 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.52 
 
 
706 aa  107  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  30.9 
 
 
575 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  29.21 
 
 
712 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  25.78 
 
 
870 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  27.81 
 
 
715 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  30.9 
 
 
527 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  31.58 
 
 
591 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  29.41 
 
 
696 aa  104  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  30.56 
 
 
462 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  30.56 
 
 
462 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  30.56 
 
 
462 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  29.07 
 
 
696 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  30.9 
 
 
465 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  27.24 
 
 
891 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  28.22 
 
 
668 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  27.33 
 
 
714 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  27.54 
 
 
726 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  28.77 
 
 
689 aa  102  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  29.97 
 
 
576 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  30.2 
 
 
688 aa  101  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  28.91 
 
 
682 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  29.97 
 
 
685 aa  100  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  29.29 
 
 
684 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>