More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4118 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4118  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 393 aa  798    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000089242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  32.34 
 
 		 668 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  31.03 
 
 		 426 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  31.18 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  30.92 
 
 		 704 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  28.92 
 
 		 683 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  30.21 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  30.71 
 
 		 717 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.68 
 
 		 684 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  30.86 
 
 		 694 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  28.43 
 
 		 688 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  30.92 
 
 		 578 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  28.5 
 
 		 711 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  28.43 
 
 		 684 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  29.59 
 
 		 433 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  29.7 
 
 		 710 aa  173  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  28.76 
 
 		 420 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  28.19 
 
 		 684 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  29.06 
 
 		 698 aa  172  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  31.09 
 
 		 580 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  28.43 
 
 		 684 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  29.06 
 
 		 698 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  28.5 
 
 		 682 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  29.35 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.19 
 
 		 706 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.61 
 
 		 718 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  28.95 
 
 		 683 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  28.9 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  30.6 
 
 		 712 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  28.95 
 
 		 683 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  28.95 
 
 		 683 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  28.12 
 
 		 718 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  28.33 
 
 		 692 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  29.66 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  28.71 
 
 		 683 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  29.26 
 
 		 696 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  28.47 
 
 		 683 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  29.26 
 
 		 696 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  28.5 
 
 		 689 aa  169  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  27.83 
 
 		 685 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  29.74 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  28.57 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  28.57 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  28.04 
 
 		 683 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  28.57 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  28.57 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  28.12 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  28.12 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  27.79 
 
 		 706 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  28.97 
 
 		 706 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  27.45 
 
 		 682 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  27.64 
 
 		 699 aa  162  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  29.47 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  29.47 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  29.81 
 
 		 756 aa  161  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  27.82 
 
 		 716 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  27.6 
 
 		 723 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  29.22 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  29.26 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  29.47 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  29.22 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  31.33 
 
 		 727 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  26.97 
 
 		 710 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  27.03 
 
 		 682 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  26.95 
 
 		 714 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  28.18 
 
 		 715 aa  159  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  28.54 
 
 		 721 aa  159  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  27.99 
 
 		 714 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  27.36 
 
 		 714 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  27.59 
 
 		 710 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  26.9 
 
 		 891 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  27.25 
 
 		 712 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  27.59 
 
 		 729 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  27.78 
 
 		 465 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  27.55 
 
 		 864 aa  156  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  27.78 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  27.78 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  27.78 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  28.21 
 
 		 726 aa  156  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  29 
 
 		 874 aa  156  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  31.49 
 
 		 642 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  27.82 
 
 		 527 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  26.79 
 
 		 717 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  27.82 
 
 		 575 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  27.93 
 
 		 424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  27.82 
 
 		 616 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  29.34 
 
 		 721 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  29.34 
 
 		 721 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  28.39 
 
 		 576 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  26.09 
 
 		 944 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  26.28 
 
 		 710 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  26.99 
 
 		 792 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.2 
 
 		 582 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  29.48 
 
 		 583 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  26.61 
 
 		 870 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  26.87 
 
 		 926 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  27.91 
 
 		 591 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  26.87 
 
 		 946 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  35.38 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  26.7 
 
 		 523 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>