More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3587 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  99.51 
 
 		 412 aa  816    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  99.76 
 
 		 412 aa  819    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  86.17 
 
 		 426 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  99.03 
 
 		 412 aa  813    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  86.17 
 
 		 426 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  100 
 
 		 386 aa  771    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  99.51 
 
 		 412 aa  816    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  99.27 
 
 		 412 aa  816    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  100 
 
 		 412 aa  823    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  88.56 
 
 		 389 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  99.76 
 
 		 412 aa  819    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  99.27 
 
 		 412 aa  814    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  73.92 
 
 		 413 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  51.72 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  50.61 
 
 		 424 aa  401  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  47.7 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  48.43 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  50.26 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  48.02 
 
 		 460 aa  342  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  47.9 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  48.02 
 
 		 500 aa  341  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  40.7 
 
 		 689 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  41.12 
 
 		 547 aa  283  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.65 
 
 		 685 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  38.26 
 
 		 580 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  38.39 
 
 		 684 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  39.29 
 
 		 682 aa  270  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  37.86 
 
 		 683 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  37.86 
 
 		 683 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  38.24 
 
 		 683 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.46 
 
 		 684 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  38.61 
 
 		 683 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  38.15 
 
 		 684 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  38.07 
 
 		 682 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  37.62 
 
 		 683 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  38.15 
 
 		 684 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.12 
 
 		 706 aa  266  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  38.07 
 
 		 683 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  38.55 
 
 		 688 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  37.77 
 
 		 683 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  37.53 
 
 		 578 aa  262  8.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  44.23 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  36.28 
 
 		 422 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  35.82 
 
 		 682 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  38.06 
 
 		 583 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  37.29 
 
 		 710 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  37.2 
 
 		 718 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  37.62 
 
 		 692 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  37.5 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  34.47 
 
 		 756 aa  240  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.91 
 
 		 582 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.98 
 
 		 718 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  37.29 
 
 		 668 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  34.69 
 
 		 721 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  34.69 
 
 		 721 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  35.8 
 
 		 694 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  34.93 
 
 		 714 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  32.21 
 
 		 792 aa  233  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  37.65 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  33.33 
 
 		 698 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  33.33 
 
 		 698 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  37.12 
 
 		 704 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  38 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  35.09 
 
 		 727 aa  229  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  34.91 
 
 		 944 aa  229  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  34.62 
 
 		 711 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  35.48 
 
 		 710 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  32.95 
 
 		 729 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  33.33 
 
 		 706 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  31.81 
 
 		 723 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  35.12 
 
 		 591 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  32.58 
 
 		 926 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  31.83 
 
 		 729 aa  219  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  33.08 
 
 		 946 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  32.3 
 
 		 696 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  32.54 
 
 		 696 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  35.27 
 
 		 717 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  35.55 
 
 		 567 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  32.29 
 
 		 710 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  35.99 
 
 		 523 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  35.63 
 
 		 706 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  33.41 
 
 		 712 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  32.36 
 
 		 715 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  33.56 
 
 		 710 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  34.47 
 
 		 714 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  32.92 
 
 		 870 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  34.74 
 
 		 576 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  31.89 
 
 		 716 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  30.29 
 
 		 657 aa  210  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  32.42 
 
 		 894 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  29.11 
 
 		 642 aa  209  8e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  34.05 
 
 		 699 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  34 
 
 		 462 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  34 
 
 		 462 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  30.41 
 
 		 630 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  34 
 
 		 462 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  34 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  34 
 
 		 575 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  30.25 
 
 		 636 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  31.58 
 
 		 712 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>