More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3804 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  100 
 
 		 413 aa  832    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  71.6 
 
 		 412 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  71.36 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  71.36 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  71.36 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  71.36 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  71.36 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  71.36 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  74.15 
 
 		 386 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  71.36 
 
 		 412 aa  579  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  74.8 
 
 		 389 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  74.73 
 
 		 426 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  74.46 
 
 		 426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  48.19 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  46.99 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  47.34 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  48.77 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  47.49 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  48.59 
 
 		 460 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  48.59 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  48.59 
 
 		 458 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  39.17 
 
 		 683 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  38.89 
 
 		 689 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  39.13 
 
 		 684 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  39.27 
 
 		 683 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  39.32 
 
 		 683 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  39.32 
 
 		 683 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  39.42 
 
 		 684 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  39.32 
 
 		 683 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  38.89 
 
 		 684 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  36.99 
 
 		 580 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  39.42 
 
 		 684 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  36.98 
 
 		 547 aa  269  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  39.47 
 
 		 683 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  38.83 
 
 		 682 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.35 
 
 		 685 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  39.09 
 
 		 683 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  38.41 
 
 		 682 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  38.41 
 
 		 688 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.48 
 
 		 706 aa  253  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  36.21 
 
 		 578 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  36.41 
 
 		 682 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  36.77 
 
 		 583 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  41.75 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  33.25 
 
 		 756 aa  232  9e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.36 
 
 		 582 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  35.84 
 
 		 694 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  31.14 
 
 		 792 aa  229  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  35.83 
 
 		 714 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  35.65 
 
 		 721 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  35.65 
 
 		 721 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  35.93 
 
 		 710 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  34.28 
 
 		 711 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  35.52 
 
 		 668 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  34.26 
 
 		 710 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  33.74 
 
 		 692 aa  222  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  35.32 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.99 
 
 		 718 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  34.75 
 
 		 718 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  35.68 
 
 		 420 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  34.49 
 
 		 591 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  35.9 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  32.61 
 
 		 698 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  32.61 
 
 		 698 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  35.42 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  30.41 
 
 		 723 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  33.33 
 
 		 706 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  34.49 
 
 		 567 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  31.42 
 
 		 944 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  34.29 
 
 		 523 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  34.83 
 
 		 704 aa  212  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  31.26 
 
 		 696 aa  211  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  31.03 
 
 		 696 aa  211  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  30.66 
 
 		 729 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.81 
 
 		 874 aa  209  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  32.76 
 
 		 465 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  32.76 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  32.76 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  32.76 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  31.29 
 
 		 727 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  32.76 
 
 		 575 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  33 
 
 		 576 aa  207  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  32.76 
 
 		 527 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  31.19 
 
 		 716 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  32.76 
 
 		 616 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  31.09 
 
 		 729 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  30.63 
 
 		 636 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  30.56 
 
 		 630 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  31.92 
 
 		 891 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  34.82 
 
 		 543 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  30.92 
 
 		 926 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  31.77 
 
 		 870 aa  203  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  33 
 
 		 543 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  30.7 
 
 		 715 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  31.87 
 
 		 710 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  34.13 
 
 		 893 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  32.07 
 
 		 712 aa  200  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  30.67 
 
 		 946 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  30.39 
 
 		 712 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  32.84 
 
 		 553 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>