More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03243 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  100 
 
 		 412 aa  823    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  99.76 
 
 		 412 aa  820    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  86.17 
 
 		 426 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  86.17 
 
 		 426 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  823    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  99.27 
 
 		 412 aa  816    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  99.51 
 
 		 412 aa  816    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  99.48 
 
 		 386 aa  766    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  99.76 
 
 		 412 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  99.03 
 
 		 412 aa  813    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  88.56 
 
 		 389 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  99.27 
 
 		 412 aa  815    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  73.66 
 
 		 413 aa  557  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  51.47 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  50.36 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  47.94 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  50 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  47.94 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  47.41 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  47.52 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  47.52 
 
 		 500 aa  336  5.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  40.45 
 
 		 689 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  40.63 
 
 		 547 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.16 
 
 		 685 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  38.37 
 
 		 683 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  38.01 
 
 		 580 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  37.83 
 
 		 682 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.88 
 
 		 706 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  37.77 
 
 		 683 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  37.91 
 
 		 684 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  38.81 
 
 		 682 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  37.77 
 
 		 683 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  37.77 
 
 		 683 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  37.83 
 
 		 683 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  37.68 
 
 		 684 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.98 
 
 		 684 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  37.53 
 
 		 683 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  38.31 
 
 		 688 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  37.68 
 
 		 684 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  37.29 
 
 		 683 aa  259  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  37.29 
 
 		 578 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  44.23 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  36.04 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  35.58 
 
 		 682 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  36.97 
 
 		 718 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  37.38 
 
 		 692 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  37.59 
 
 		 583 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  37.26 
 
 		 420 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  37.05 
 
 		 710 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  34.23 
 
 		 756 aa  238  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.74 
 
 		 718 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.44 
 
 		 582 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  35.56 
 
 		 694 aa  233  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  36.8 
 
 		 668 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  31.98 
 
 		 792 aa  232  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  34.47 
 
 		 721 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  34.47 
 
 		 721 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  37.41 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  34.7 
 
 		 714 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  36.88 
 
 		 704 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  37.26 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  34.87 
 
 		 727 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  34.38 
 
 		 711 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  33.1 
 
 		 698 aa  226  8e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  33.1 
 
 		 698 aa  226  8e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  34.41 
 
 		 944 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  35.25 
 
 		 710 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  32.95 
 
 		 729 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  31.59 
 
 		 723 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  31.6 
 
 		 729 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  34.88 
 
 		 591 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  33.11 
 
 		 706 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  35.03 
 
 		 717 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  32.07 
 
 		 696 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  35.29 
 
 		 567 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  32.58 
 
 		 946 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  32.3 
 
 		 696 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  32.08 
 
 		 926 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  33.18 
 
 		 712 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  32.07 
 
 		 710 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 710 aa  213  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  34.25 
 
 		 714 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  35.75 
 
 		 523 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  35.4 
 
 		 706 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  30.41 
 
 		 630 aa  210  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  32.01 
 
 		 715 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  30.25 
 
 		 636 aa  209  7e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  34.49 
 
 		 576 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  28.9 
 
 		 642 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  30.08 
 
 		 657 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  33.81 
 
 		 699 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  32.43 
 
 		 870 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  31.66 
 
 		 716 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  32.17 
 
 		 894 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  33.75 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  33.75 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  33.75 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  31.19 
 
 		 891 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  33.75 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  32.18 
 
 		 717 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>