More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2255 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 372 aa  729    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  48.69 
 
 		 694 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  43.53 
 
 		 699 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  42.41 
 
 		 706 aa  244  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  44.58 
 
 		 710 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  40.57 
 
 		 698 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  40.57 
 
 		 698 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  37.11 
 
 		 723 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  41.29 
 
 		 683 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  40.32 
 
 		 683 aa  223  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  39.6 
 
 		 711 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  41.26 
 
 		 756 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  39.67 
 
 		 682 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  41.16 
 
 		 718 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  40.45 
 
 		 682 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  40.65 
 
 		 688 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  39.74 
 
 		 684 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  40.51 
 
 		 718 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  43.61 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  42.26 
 
 		 668 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.64 
 
 		 685 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  39.03 
 
 		 683 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  39.35 
 
 		 683 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  39.35 
 
 		 683 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  39.8 
 
 		 689 aa  212  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  39.35 
 
 		 683 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  39.35 
 
 		 683 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  40.89 
 
 		 682 aa  212  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  39.1 
 
 		 684 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  39.1 
 
 		 684 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  39.82 
 
 		 710 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  37.8 
 
 		 715 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  39.1 
 
 		 684 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  37.38 
 
 		 792 aa  209  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  42.07 
 
 		 696 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  38.97 
 
 		 717 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  39.93 
 
 		 714 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  41.72 
 
 		 696 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  41.18 
 
 		 721 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  41.18 
 
 		 721 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  38.64 
 
 		 547 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  37.03 
 
 		 716 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  36.31 
 
 		 712 aa  206  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  37.62 
 
 		 692 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  41.83 
 
 		 523 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  38.49 
 
 		 704 aa  205  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  39.56 
 
 		 706 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  43.53 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  40.48 
 
 		 710 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  43.8 
 
 		 420 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  38.8 
 
 		 729 aa  202  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  36.98 
 
 		 580 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  39.58 
 
 		 706 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  41.74 
 
 		 717 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  40.2 
 
 		 567 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  38.93 
 
 		 712 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  36.07 
 
 		 642 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  39.31 
 
 		 578 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  42.81 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  36.98 
 
 		 727 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  36.6 
 
 		 721 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  39.07 
 
 		 714 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  39.54 
 
 		 591 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  38.68 
 
 		 710 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  39.75 
 
 		 711 aa  192  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  38.86 
 
 		 573 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  40.71 
 
 		 527 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  40.71 
 
 		 575 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  38.56 
 
 		 543 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  40.71 
 
 		 616 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  40.75 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  40.75 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  40.75 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  40.75 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  36.73 
 
 		 714 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  38.87 
 
 		 543 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  37.74 
 
 		 726 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  38.98 
 
 		 576 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  38.76 
 
 		 553 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  38.24 
 
 		 543 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  35.37 
 
 		 657 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  38.24 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  38.76 
 
 		 553 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  36.75 
 
 		 729 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.66 
 
 		 874 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  35.9 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  33.74 
 
 		 944 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  32.24 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  34.03 
 
 		 987 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  37.24 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  34.23 
 
 		 887 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  38.01 
 
 		 583 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.58 
 
 		 894 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  34.24 
 
 		 887 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.42 
 
 		 582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  35.62 
 
 		 433 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  34.23 
 
 		 882 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  36.08 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  35.58 
 
 		 424 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  36.27 
 
 		 426 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>