More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1743 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 1302 aa  2548    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1265  type II and III secretion system protein  28.31 
 
 		 1519 aa  293  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00244048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0836  type II and III secretion system protein  36.06 
 
 		 1282 aa  209  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934463  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  34.53 
 
 		 1282 aa  200  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  24.84 
 
 		 1421 aa  144  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  23.65 
 
 		 602 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  32.7 
 
 		 698 aa  110  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  32.63 
 
 		 492 aa  105  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  34.57 
 
 		 881 aa  104  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  34.29 
 
 		 667 aa  103  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  38.04 
 
 		 386 aa  102  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  33.51 
 
 		 734 aa  102  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  33.12 
 
 		 457 aa  100  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  28.21 
 
 		 760 aa  100  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2619  type II and III secretion system protein  33.94 
 
 		 662 aa  100  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  37.34 
 
 		 423 aa  99.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2293  type II and III secretion system protein  29.15 
 
 		 621 aa  99  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  33.77 
 
 		 468 aa  99  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  29.15 
 
 		 621 aa  98.6  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  31.82 
 
 		 653 aa  98.6  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  33.77 
 
 		 454 aa  98.6  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  31.55 
 
 		 484 aa  98.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3478  type II and III secretion system protein  29.28 
 
 		 621 aa  98.2  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883707  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  32.14 
 
 		 754 aa  97.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  30.25 
 
 		 686 aa  97.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  34.78 
 
 		 444 aa  97.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  30.23 
 
 		 625 aa  96.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  35.22 
 
 		 451 aa  96.3  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  34.39 
 
 		 461 aa  95.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  32.3 
 
 		 656 aa  95.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  33.16 
 
 		 789 aa  95.5  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  33.12 
 
 		 482 aa  95.1  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  33.54 
 
 		 478 aa  95.1  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  33.54 
 
 		 478 aa  95.1  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 		 614 aa  94.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  33.77 
 
 		 454 aa  94.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  32.32 
 
 		 697 aa  94.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  31.76 
 
 		 422 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  34.81 
 
 		 441 aa  94.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  35.26 
 
 		 432 aa  93.6  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  33.76 
 
 		 443 aa  94  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  32.35 
 
 		 416 aa  94  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  35.03 
 
 		 445 aa  93.6  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  35.26 
 
 		 494 aa  93.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  32.9 
 
 		 452 aa  93.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  35.26 
 
 		 432 aa  93.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  35.71 
 
 		 473 aa  94  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  33.77 
 
 		 454 aa  94  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  35.26 
 
 		 432 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  33.77 
 
 		 454 aa  94  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  34.81 
 
 		 441 aa  93.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  30.81 
 
 		 615 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  34.81 
 
 		 441 aa  93.2  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  34.81 
 
 		 441 aa  93.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  34.81 
 
 		 441 aa  93.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  33.96 
 
 		 451 aa  93.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  32.7 
 
 		 779 aa  92.8  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  38.46 
 
 		 436 aa  92.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  33.53 
 
 		 460 aa  92.4  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  33.33 
 
 		 408 aa  92.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  33.53 
 
 		 460 aa  92.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  33.33 
 
 		 416 aa  92.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  37.66 
 
 		 436 aa  92  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  30.86 
 
 		 657 aa  92  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  32.48 
 
 		 431 aa  92  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  30.36 
 
 		 493 aa  91.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  34.19 
 
 		 469 aa  91.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  31.68 
 
 		 720 aa  91.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  28.14 
 
 		 672 aa  91.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  26.35 
 
 		 658 aa  90.9  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2693  type II and III secretion system protein  28.97 
 
 		 479 aa  89.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  30.59 
 
 		 419 aa  89.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2920  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  30.37 
 
 		 595 aa  89.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  25.87 
 
 		 763 aa  89  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  33.12 
 
 		 443 aa  89.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  32.34 
 
 		 460 aa  88.6  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  32.04 
 
 		 446 aa  88.6  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  33.54 
 
 		 443 aa  88.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  33.54 
 
 		 443 aa  88.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  33.54 
 
 		 443 aa  88.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6875  type II and III secretion system protein  30.37 
 
 		 561 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2851  type II and III secretion system protein  32.47 
 
 		 895 aa  87.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17629  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  31.74 
 
 		 463 aa  88.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  27.54 
 
 		 675 aa  86.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  31.22 
 
 		 748 aa  87.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  26.53 
 
 		 466 aa  87  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0246  type II and III secretion system protein  26.5 
 
 		 714 aa  87.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  25.1 
 
 		 745 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  30.97 
 
 		 466 aa  87  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  27.55 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  26.02 
 
 		 819 aa  86.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  31.43 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4345  type II and III secretion system protein  31.43 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  31.58 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  30 
 
 		 752 aa  85.9  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  31.79 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  28.14 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  32.45 
 
 		 764 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  29.38 
 
 		 662 aa  85.9  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  32.4 
 
 		 679 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>