More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2851 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2851  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 895 aa  1779    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17629  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1098  type II and III secretion system protein  28.38 
 
 		 907 aa  249  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  hitchhiker  0.000681519 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1638  type II and III secretion system protein  28.46 
 
 		 833 aa  186  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  29.32 
 
 		 697 aa  109  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  27.64 
 
 		 681 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  26.37 
 
 		 689 aa  99.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 675 aa  97.8  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  25.94 
 
 		 658 aa  95.9  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  27.71 
 
 		 799 aa  94.7  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  28.01 
 
 		 662 aa  91.3  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  26.67 
 
 		 642 aa  91.3  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  24.09 
 
 		 578 aa  90.5  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  25.96 
 
 		 672 aa  90.1  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  29.5 
 
 		 748 aa  89.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  25.34 
 
 		 724 aa  88.6  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  26.08 
 
 		 714 aa  88.6  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  26.81 
 
 		 703 aa  88.6  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1265  type II and III secretion system protein  39.37 
 
 		 1519 aa  87  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00244048  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  32.47 
 
 		 1302 aa  87.4  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  26.22 
 
 		 705 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  29.82 
 
 		 716 aa  87.4  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  25.84 
 
 		 668 aa  86.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  25.14 
 
 		 686 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  25.14 
 
 		 686 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  25.14 
 
 		 686 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  25.14 
 
 		 686 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  25.14 
 
 		 686 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  25.41 
 
 		 783 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  27.9 
 
 		 1282 aa  84  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0836  type II and III secretion system protein  30.57 
 
 		 1282 aa  83.2  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  28.88 
 
 		 670 aa  83.2  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  25.6 
 
 		 569 aa  83.2  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  29.35 
 
 		 539 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  25.14 
 
 		 793 aa  82.8  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  27.03 
 
 		 630 aa  82.4  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  24.59 
 
 		 641 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  27.05 
 
 		 729 aa  82.4  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  28.08 
 
 		 794 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  28.29 
 
 		 744 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 750 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 757 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 757 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 757 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 757 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 757 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  30.28 
 
 		 787 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  24.46 
 
 		 705 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  24.8 
 
 		 706 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  24.32 
 
 		 704 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  26.15 
 
 		 484 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  37.21 
 
 		 478 aa  80.5  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  27.98 
 
 		 783 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  37.21 
 
 		 478 aa  80.5  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  23.49 
 
 		 740 aa  79.7  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  24.67 
 
 		 775 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  25.27 
 
 		 636 aa  79.7  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  25.35 
 
 		 682 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  30.33 
 
 		 657 aa  80.1  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  26.45 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.63 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  26.41 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  25.34 
 
 		 705 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  24.79 
 
 		 673 aa  79.7  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  25.14 
 
 		 803 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  29.05 
 
 		 776 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  25.72 
 
 		 674 aa  78.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  31.46 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  24.05 
 
 		 703 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  23.81 
 
 		 655 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  31.46 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  27.14 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  23.98 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  24.94 
 
 		 710 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  24.79 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  26.22 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  35.88 
 
 		 574 aa  77.8  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  25.62 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  26.65 
 
 		 792 aa  77.4  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  28.1 
 
 		 451 aa  77  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  22.55 
 
 		 683 aa  77  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  24.32 
 
 		 702 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.48 
 
 		 684 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  24.8 
 
 		 804 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  29.33 
 
 		 507 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  30.05 
 
 		 460 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  26.91 
 
 		 803 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  26.98 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.8 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  28.63 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  29.6 
 
 		 814 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  30.37 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  37.76 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  27.16 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  26.92 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  24.06 
 
 		 684 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  27.85 
 
 		 640 aa  75.1  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.58 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  24.48 
 
 		 684 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  26.84 
 
 		 683 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>