More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1036 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  100 
 
 		 506 aa  1021    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  48.22 
 
 		 506 aa  462  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  49.9 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  46.22 
 
 		 541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  46.98 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  44.8 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  44.8 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  44.8 
 
 		 470 aa  388  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  41.28 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  35.95 
 
 		 563 aa  262  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.65 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.4 
 
 		 830 aa  150  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  24.69 
 
 		 625 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.22 
 
 		 563 aa  146  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  27.83 
 
 		 546 aa  146  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.58 
 
 		 562 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.53 
 
 		 556 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  31.34 
 
 		 567 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  29.97 
 
 		 609 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.59 
 
 		 572 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  23.85 
 
 		 585 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  28.16 
 
 		 559 aa  139  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.7 
 
 		 558 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  25.57 
 
 		 569 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.89 
 
 		 550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.09 
 
 		 556 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.42 
 
 		 561 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  25.49 
 
 		 549 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.42 
 
 		 561 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.51 
 
 		 561 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.18 
 
 		 559 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.18 
 
 		 559 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.48 
 
 		 559 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.48 
 
 		 559 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  29.46 
 
 		 560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.84 
 
 		 538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  24.57 
 
 		 546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  28.35 
 
 		 561 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  25.71 
 
 		 569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  26.02 
 
 		 539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  30.17 
 
 		 581 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  24.31 
 
 		 530 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  23.08 
 
 		 537 aa  127  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  23.31 
 
 		 544 aa  126  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  24.26 
 
 		 614 aa  126  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  25.3 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  26.58 
 
 		 547 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.23 
 
 		 574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  23.3 
 
 		 543 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3405  type II and III secretion system protein  27.55 
 
 		 594 aa  109  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  30.86 
 
 		 745 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  28.03 
 
 		 1421 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  27.18 
 
 		 794 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  30.96 
 
 		 686 aa  97.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  27.65 
 
 		 729 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  28.89 
 
 		 698 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  28.89 
 
 		 698 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  28.32 
 
 		 829 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  28.12 
 
 		 602 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  29.51 
 
 		 717 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.95 
 
 		 874 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0639  type II and III secretion system protein  34.25 
 
 		 596 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  30.98 
 
 		 767 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  33.52 
 
 		 881 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  27.01 
 
 		 819 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_002978  WD0500  type II secretion system protein, putative  25.67 
 
 		 500 aa  91.3  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  30.09 
 
 		 698 aa  91.3  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  25.24 
 
 		 810 aa  90.9  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  27.74 
 
 		 682 aa  90.9  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  25.43 
 
 		 987 aa  90.1  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  28.24 
 
 		 349 aa  90.5  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  32.8 
 
 		 712 aa  90.1  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  32.09 
 
 		 494 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  33.86 
 
 		 527 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  27.87 
 
 		 733 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  27.1 
 
 		 915 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  30.36 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 692 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  23.59 
 
 		 781 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  30.36 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  25.44 
 
 		 718 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  28.48 
 
 		 660 aa  88.2  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  27.03 
 
 		 738 aa  87.8  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  25.39 
 
 		 740 aa  87.8  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  26.52 
 
 		 891 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  23.26 
 
 		 781 aa  87.4  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  30.6 
 
 		 635 aa  87.4  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  28.68 
 
 		 670 aa  87.4  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  25.19 
 
 		 667 aa  87  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  29.09 
 
 		 641 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  27.86 
 
 		 776 aa  87  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  28.83 
 
 		 580 aa  86.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1081  type II and III secretion system protein  27.61 
 
 		 602 aa  86.7  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.869839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  25.33 
 
 		 797 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  27.94 
 
 		 751 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.09 
 
 		 718 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  29.11 
 
 		 757 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  30.61 
 
 		 681 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  27.27 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  27.31 
 
 		 833 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>