More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0246 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0246  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 714 aa  1430    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2693  type II and III secretion system protein  42.32 
 
 		 479 aa  303  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2310  type II and III secretion system protein  34.12 
 
 		 443 aa  246  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  34.81 
 
 		 436 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  33.77 
 
 		 436 aa  220  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  34.72 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2920  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  29.95 
 
 		 595 aa  197  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6875  type II and III secretion system protein  29.67 
 
 		 561 aa  191  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4345  type II and III secretion system protein  29.88 
 
 		 451 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  33 
 
 		 490 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  30.29 
 
 		 495 aa  157  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  32.56 
 
 		 483 aa  153  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  30.29 
 
 		 451 aa  152  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  29.37 
 
 		 473 aa  152  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  30.42 
 
 		 479 aa  151  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  29.36 
 
 		 469 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  30.53 
 
 		 454 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  30.53 
 
 		 454 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  30 
 
 		 484 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  30.99 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  30.99 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  30.99 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  30.99 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  30.99 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  30.02 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  30.99 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  30.94 
 
 		 493 aa  144  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  29.37 
 
 		 517 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2117  type II and III secretion system protein  30.12 
 
 		 356 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  35.1 
 
 		 454 aa  140  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  28.76 
 
 		 494 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  28.76 
 
 		 482 aa  140  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  36.08 
 
 		 457 aa  140  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  30.65 
 
 		 460 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  29.27 
 
 		 461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  30.38 
 
 		 464 aa  138  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  31.15 
 
 		 461 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  29.51 
 
 		 460 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  29 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  33.1 
 
 		 386 aa  134  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  28.42 
 
 		 460 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  29.95 
 
 		 416 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  29 
 
 		 501 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  29.38 
 
 		 466 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  29.58 
 
 		 443 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  29.58 
 
 		 443 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  29.58 
 
 		 443 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  28.5 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  27.27 
 
 		 496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  27 
 
 		 530 aa  132  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  28.73 
 
 		 466 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  30.67 
 
 		 474 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  41.05 
 
 		 526 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  30.69 
 
 		 432 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  30.69 
 
 		 432 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  30.69 
 
 		 432 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  30.69 
 
 		 441 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  30.69 
 
 		 441 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  28.68 
 
 		 454 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  30.69 
 
 		 441 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  30.69 
 
 		 441 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  27.78 
 
 		 482 aa  130  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  29.13 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  28.72 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  29.13 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  34.6 
 
 		 443 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  30.69 
 
 		 441 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  27.93 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  29.92 
 
 		 491 aa  128  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  27.64 
 
 		 622 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  27.18 
 
 		 478 aa  127  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  27.46 
 
 		 493 aa  127  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  31.06 
 
 		 494 aa  127  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  30.67 
 
 		 487 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  30.19 
 
 		 484 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  28.2 
 
 		 486 aa  125  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  29.93 
 
 		 740 aa  124  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  42.07 
 
 		 416 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  26.04 
 
 		 514 aa  124  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  34.22 
 
 		 431 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  37.87 
 
 		 492 aa  123  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 444 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  34.77 
 
 		 473 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  39.3 
 
 		 419 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  38.07 
 
 		 483 aa  120  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  28.34 
 
 		 497 aa  120  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  28.45 
 
 		 446 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  26.04 
 
 		 423 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  39.47 
 
 		 439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  33.99 
 
 		 578 aa  119  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  25.33 
 
 		 571 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  25.74 
 
 		 663 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  40.35 
 
 		 455 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  38.04 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  27.7 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  26.07 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  25.56 
 
 		 700 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  36.61 
 
 		 461 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>