More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2743 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2743  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 509 aa  996    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.230673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1332  type II and III secretion system protein  49.37 
 
 		 771 aa  348  9e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1729  type II and III secretion system protein  30.23 
 
 		 673 aa  155  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514108  normal  0.0788393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  28.68 
 
 		 648 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3590  type II and III secretion system protein  27.76 
 
 		 670 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  27.93 
 
 		 748 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  26.63 
 
 		 635 aa  103  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  31.18 
 
 		 1421 aa  103  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  28.48 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  27.73 
 
 		 685 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  27.25 
 
 		 684 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  28.57 
 
 		 684 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  29.75 
 
 		 573 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  27.25 
 
 		 630 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  29.45 
 
 		 543 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.57 
 
 		 684 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  27.94 
 
 		 634 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  25.72 
 
 		 641 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  28.83 
 
 		 543 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  29.14 
 
 		 543 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  29.45 
 
 		 371 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  27.89 
 
 		 684 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  29.77 
 
 		 693 aa  97.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  26.63 
 
 		 683 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  26.63 
 
 		 683 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  26.14 
 
 		 523 aa  97.4  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  26.63 
 
 		 683 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  28.49 
 
 		 580 aa  96.7  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  26.63 
 
 		 683 aa  96.7  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  29.51 
 
 		 655 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  28.8 
 
 		 460 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  28.16 
 
 		 756 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  29.45 
 
 		 553 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  28.8 
 
 		 500 aa  94.7  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  28.8 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  27.54 
 
 		 377 aa  94.4  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  26.05 
 
 		 683 aa  93.2  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  29.14 
 
 		 553 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  27.18 
 
 		 881 aa  93.2  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  26.78 
 
 		 527 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  26.65 
 
 		 758 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  26.14 
 
 		 640 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  27.07 
 
 		 576 aa  93.2  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  26.78 
 
 		 616 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  26.89 
 
 		 640 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  26.78 
 
 		 575 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  26.78 
 
 		 465 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  26.78 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  26.78 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  26.89 
 
 		 640 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  27.89 
 
 		 712 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  26.78 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  26.74 
 
 		 668 aa  91.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  27.91 
 
 		 776 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  27.68 
 
 		 683 aa  90.9  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  28.32 
 
 		 696 aa  90.5  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  28.12 
 
 		 784 aa  90.5  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  28.12 
 
 		 784 aa  90.5  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  28.32 
 
 		 696 aa  90.5  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  27.3 
 
 		 420 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  26.14 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  25.59 
 
 		 683 aa  90.1  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  25.2 
 
 		 658 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  28.19 
 
 		 682 aa  90.1  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  24.49 
 
 		 674 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  26.63 
 
 		 688 aa  89.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  26.79 
 
 		 740 aa  89.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  26.67 
 
 		 783 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  27.3 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  27.34 
 
 		 829 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  26.35 
 
 		 426 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  27.53 
 
 		 810 aa  88.2  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  27.25 
 
 		 636 aa  88.2  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  27.04 
 
 		 710 aa  87.8  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  27.09 
 
 		 808 aa  87.4  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  25.53 
 
 		 389 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  26.51 
 
 		 658 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  29.58 
 
 		 567 aa  87  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  29.27 
 
 		 682 aa  87  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  28.57 
 
 		 704 aa  87  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  26.57 
 
 		 738 aa  87  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  26.05 
 
 		 426 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.14 
 
 		 718 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  27.71 
 
 		 578 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  27.47 
 
 		 657 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  27.18 
 
 		 654 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3051  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.59 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  27.56 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  29.13 
 
 		 591 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  24.69 
 
 		 672 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  27.56 
 
 		 870 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  27.18 
 
 		 654 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  27.59 
 
 		 681 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3088  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.59 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.994223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  26.56 
 
 		 640 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  27.18 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  25.39 
 
 		 893 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  24.86 
 
 		 718 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3020  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.59 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3103  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26.59 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000610588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>