More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3590 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014214  Mesil_3590  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 670 aa  1282    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2743  type II and III secretion system protein  28.39 
 
 		 509 aa  107  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.230673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1332  type II and III secretion system protein  29.63 
 
 		 771 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  30.03 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  27.74 
 
 		 372 aa  100  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  25.96 
 
 		 729 aa  97.4  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  27.8 
 
 		 630 aa  96.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1729  type II and III secretion system protein  27.72 
 
 		 673 aa  95.9  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514108  normal  0.0788393 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  27.21 
 
 		 636 aa  95.9  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  29.29 
 
 		 756 aa  95.1  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  27.52 
 
 		 413 aa  90.9  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  27.02 
 
 		 420 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.7 
 
 		 894 aa  88.2  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  26.62 
 
 		 642 aa  88.6  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  27.07 
 
 		 657 aa  88.2  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  27.86 
 
 		 893 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  27.07 
 
 		 420 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  26.82 
 
 		 426 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  26.82 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.74 
 
 		 718 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  26.67 
 
 		 718 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  27.86 
 
 		 1421 aa  85.1  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  27.07 
 
 		 689 aa  85.5  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  26.52 
 
 		 694 aa  85.5  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  26.17 
 
 		 578 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  26.82 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  29.01 
 
 		 679 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  28.48 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  27.07 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  26.82 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  26.43 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  25.6 
 
 		 711 aa  84.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  26.82 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  27.85 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  27.1 
 
 		 668 aa  84  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  27.44 
 
 		 720 aa  84  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  24.7 
 
 		 812 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  26.49 
 
 		 412 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  26.49 
 
 		 412 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  26.01 
 
 		 887 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  26.49 
 
 		 412 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  26.01 
 
 		 882 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  27.85 
 
 		 458 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  26.1 
 
 		 424 aa  83.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  26.84 
 
 		 792 aa  83.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  26.49 
 
 		 412 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  27.27 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  28.16 
 
 		 683 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  31.43 
 
 		 603 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  26.49 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  26.01 
 
 		 887 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  26.16 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  27.3 
 
 		 684 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  27.72 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  25.99 
 
 		 704 aa  82  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  26.16 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  26.69 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  30.35 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  23.13 
 
 		 760 aa  81.3  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  27.81 
 
 		 547 aa  80.9  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  26.01 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.54 
 
 		 685 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  24.52 
 
 		 717 aa  80.5  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  24 
 
 		 710 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.65 
 
 		 874 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  25.99 
 
 		 891 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  27.5 
 
 		 684 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  25.63 
 
 		 683 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  28.79 
 
 		 683 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  26.84 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  30.23 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  27.5 
 
 		 684 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  27.95 
 
 		 683 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  26.58 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  28.92 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  27.95 
 
 		 683 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  27.95 
 
 		 683 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  27.02 
 
 		 684 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 944 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  24.09 
 
 		 692 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  29.5 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  28.07 
 
 		 829 aa  78.2  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  29.95 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  26.25 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  26.23 
 
 		 946 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  24.77 
 
 		 717 aa  77.8  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  27.16 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  24.09 
 
 		 567 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  27.02 
 
 		 710 aa  77.4  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  23.93 
 
 		 655 aa  77  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  28.36 
 
 		 477 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  30.52 
 
 		 833 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  25.21 
 
 		 682 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  25.56 
 
 		 683 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  23.76 
 
 		 591 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  30.37 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  30.6 
 
 		 700 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  27.19 
 
 		 682 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  29.44 
 
 		 690 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  26.81 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>