More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2583 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 749 aa  1498    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  49.62 
 
 		 667 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  46.57 
 
 		 656 aa  532  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1300  type II secretion system protein D  46.29 
 
 		 667 aa  495  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.194357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  39.55 
 
 		 653 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  44.74 
 
 		 657 aa  472  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  39.57 
 
 		 754 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  41.91 
 
 		 614 aa  442  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  42.33 
 
 		 698 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  37.95 
 
 		 621 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  34.96 
 
 		 760 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3478  type II and III secretion system protein  38.96 
 
 		 621 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883707  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2619  type II and III secretion system protein  39.2 
 
 		 662 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  39.01 
 
 		 625 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2293  type II and III secretion system protein  38.73 
 
 		 621 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  39.4 
 
 		 789 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  42.33 
 
 		 734 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  38.26 
 
 		 615 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  37 
 
 		 812 aa  364  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  32 
 
 		 822 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  31.21 
 
 		 779 aa  310  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 868 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1859  type II and III secretion system protein  34.54 
 
 		 861 aa  301  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.765108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  31.67 
 
 		 796 aa  299  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  33.55 
 
 		 870 aa  297  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1679  type II secretory pathway, component HofQ  29.44 
 
 		 767 aa  292  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1462  type II and III secretion system protein  32.33 
 
 		 769 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3789  type II and III secretion system protein  35.12 
 
 		 596 aa  274  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1469  type II and III secretion system protein  30.19 
 
 		 792 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  23.7 
 
 		 764 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  23.88 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 		 460 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.23 
 
 		 641 aa  108  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  23.88 
 
 		 1421 aa  103  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  28.79 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  37.87 
 
 		 881 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  27.44 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  25.25 
 
 		 696 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  27.4 
 
 		 780 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  23.76 
 
 		 887 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  28.44 
 
 		 460 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  23.37 
 
 		 882 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  23.37 
 
 		 887 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  27.76 
 
 		 716 aa  100  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  28.42 
 
 		 733 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  25.59 
 
 		 580 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  27.44 
 
 		 751 aa  99.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  24.24 
 
 		 893 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  22.22 
 
 		 891 aa  99.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  24.29 
 
 		 864 aa  99  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  27.94 
 
 		 492 aa  98.6  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  27.99 
 
 		 745 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  26 
 
 		 660 aa  97.8  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  24.7 
 
 		 689 aa  97.8  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  30.28 
 
 		 423 aa  97.8  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  24.77 
 
 		 808 aa  97.8  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  29.41 
 
 		 779 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  27.62 
 
 		 482 aa  97.4  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  30.28 
 
 		 439 aa  97.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  27.62 
 
 		 482 aa  97.4  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  27.62 
 
 		 482 aa  97.4  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  27.62 
 
 		 482 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  27.62 
 
 		 482 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  28.34 
 
 		 479 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  27.62 
 
 		 482 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  26.87 
 
 		 803 aa  96.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  25.75 
 
 		 635 aa  97.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  30.27 
 
 		 484 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.42 
 
 		 894 aa  96.3  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  28.95 
 
 		 478 aa  95.1  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  25.37 
 
 		 372 aa  95.1  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2310  type II and III secretion system protein  27.73 
 
 		 443 aa  95.1  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  28.08 
 
 		 682 aa  94.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  23.3 
 
 		 946 aa  94.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  23.32 
 
 		 944 aa  94.7  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  21.43 
 
 		 718 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  28.41 
 
 		 756 aa  94.4  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  26.91 
 
 		 801 aa  94.4  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  27.5 
 
 		 457 aa  94.4  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  22.22 
 
 		 987 aa  94.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  23.71 
 
 		 926 aa  94.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  29.15 
 
 		 784 aa  94  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  29.83 
 
 		 419 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 455 aa  93.6  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  28.38 
 
 		 648 aa  93.6  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  26.5 
 
 		 787 aa  93.6  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  28.16 
 
 		 681 aa  93.6  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  25.91 
 
 		 480 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  29.21 
 
 		 482 aa  93.2  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  28.46 
 
 		 493 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  27.69 
 
 		 473 aa  92.8  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  26.23 
 
 		 673 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  27.76 
 
 		 655 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  26.95 
 
 		 416 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  27.34 
 
 		 483 aa  92.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  29.45 
 
 		 516 aa  92.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  29.24 
 
 		 700 aa  91.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  27.27 
 
 		 422 aa  92  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  22.41 
 
 		 704 aa  91.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  26.83 
 
 		 805 aa  90.9  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>