More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1462 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  53.77 
 
 		 822 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  52.59 
 
 		 796 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  56.41 
 
 		 868 aa  685    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  55.59 
 
 		 870 aa  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1859  type II and III secretion system protein  55.78 
 
 		 861 aa  711    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.765108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1469  type II and III secretion system protein  76.12 
 
 		 792 aa  849    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1462  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 769 aa  1548    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1679  type II secretory pathway, component HofQ  38.46 
 
 		 767 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  33.61 
 
 		 779 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  34.55 
 
 		 754 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  32.92 
 
 		 653 aa  310  9e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  33.39 
 
 		 614 aa  300  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1300  type II secretion system protein D  36.76 
 
 		 667 aa  296  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.194357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  32.31 
 
 		 656 aa  294  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  31.49 
 
 		 667 aa  290  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  32.34 
 
 		 749 aa  286  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  30.72 
 
 		 760 aa  281  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  32.47 
 
 		 657 aa  277  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2293  type II and III secretion system protein  33.72 
 
 		 621 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  33.43 
 
 		 625 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3478  type II and III secretion system protein  33.39 
 
 		 621 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883707  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  33.67 
 
 		 621 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 		 615 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  30.82 
 
 		 734 aa  265  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  30.84 
 
 		 812 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2619  type II and III secretion system protein  30.24 
 
 		 662 aa  259  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  38.86 
 
 		 698 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  30.17 
 
 		 789 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  27.35 
 
 		 764 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3789  type II and III secretion system protein  27.35 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  24.49 
 
 		 915 aa  117  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  24.94 
 
 		 870 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  23.72 
 
 		 580 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2522  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 619 aa  114  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.417958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  23.43 
 
 		 891 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  24.39 
 
 		 864 aa  111  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  23.23 
 
 		 589 aa  109  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  29.31 
 
 		 720 aa  108  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  29.25 
 
 		 819 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  30.53 
 
 		 660 aa  107  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  24.11 
 
 		 547 aa  107  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  27.49 
 
 		 752 aa  104  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  24.39 
 
 		 926 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.06 
 
 		 894 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  28.96 
 
 		 689 aa  102  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  28.77 
 
 		 829 aa  101  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  24.9 
 
 		 717 aa  102  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  24.58 
 
 		 689 aa  100  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  26.51 
 
 		 696 aa  100  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  23.09 
 
 		 729 aa  99.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  23.52 
 
 		 944 aa  99.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  22.22 
 
 		 630 aa  99.4  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  22.95 
 
 		 578 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  27.62 
 
 		 780 aa  99  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  23.89 
 
 		 946 aa  98.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  26.87 
 
 		 716 aa  98.2  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  30.08 
 
 		 454 aa  96.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  22.22 
 
 		 636 aa  97.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  27.59 
 
 		 777 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  22.77 
 
 		 591 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  34.78 
 
 		 494 aa  95.1  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  26.46 
 
 		 655 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  23.45 
 
 		 655 aa  95.1  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  26.26 
 
 		 767 aa  94.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  29.45 
 
 		 751 aa  94.7  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  25.82 
 
 		 658 aa  94.7  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  26.58 
 
 		 686 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  26.58 
 
 		 686 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  24.93 
 
 		 492 aa  94.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  26.58 
 
 		 686 aa  94.4  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  26.58 
 
 		 686 aa  94.4  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  26.58 
 
 		 686 aa  94.4  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  28.33 
 
 		 469 aa  94.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  23.66 
 
 		 668 aa  94.4  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  27.27 
 
 		 672 aa  94  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.54 
 
 		 685 aa  92.8  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 640 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  22.53 
 
 		 412 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  22.3 
 
 		 567 aa  93.2  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  22.71 
 
 		 808 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  29.78 
 
 		 710 aa  93.2  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  22.28 
 
 		 1421 aa  92.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  28.67 
 
 		 779 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  27.27 
 
 		 681 aa  92.4  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  23.34 
 
 		 426 aa  92.4  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  24.28 
 
 		 715 aa  91.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  21.34 
 
 		 727 aa  91.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  26.45 
 
 		 675 aa  92  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  26.52 
 
 		 774 aa  92  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  26.52 
 
 		 774 aa  92  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  24.28 
 
 		 710 aa  91.7  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  32.18 
 
 		 423 aa  91.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  22.3 
 
 		 412 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  22.3 
 
 		 412 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  22.3 
 
 		 412 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  26.57 
 
 		 733 aa  91.3  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  22.3 
 
 		 412 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  25.76 
 
 		 640 aa  91.3  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  34.74 
 
 		 881 aa  90.9  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  24.21 
 
 		 696 aa  90.9  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>