More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1929 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  58.62 
 
 		 822 aa  933    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  66.67 
 
 		 870 aa  832    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 796 aa  1603    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1859  type II and III secretion system protein  63.62 
 
 		 861 aa  798    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.765108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  67.52 
 
 		 868 aa  849    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1462  type II and III secretion system protein  53.56 
 
 		 769 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1469  type II and III secretion system protein  44.87 
 
 		 792 aa  618  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1679  type II secretory pathway, component HofQ  37.89 
 
 		 767 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  33.58 
 
 		 779 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  32.18 
 
 		 754 aa  362  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  35.26 
 
 		 667 aa  348  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  32.83 
 
 		 653 aa  335  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  29.17 
 
 		 760 aa  324  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  38.19 
 
 		 657 aa  320  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  31.52 
 
 		 749 aa  317  6e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  31.36 
 
 		 656 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  33.39 
 
 		 614 aa  312  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1300  type II secretion system protein D  33.82 
 
 		 667 aa  302  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.194357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  32.35 
 
 		 698 aa  301  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  31.59 
 
 		 812 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  33.89 
 
 		 625 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3478  type II and III secretion system protein  32.53 
 
 		 621 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883707  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  32.52 
 
 		 621 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2619  type II and III secretion system protein  33.44 
 
 		 662 aa  291  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2293  type II and III secretion system protein  32.12 
 
 		 621 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  31.91 
 
 		 734 aa  279  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  33.28 
 
 		 615 aa  277  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  31.72 
 
 		 789 aa  258  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  28.59 
 
 		 764 aa  251  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3789  type II and III secretion system protein  27.67 
 
 		 596 aa  189  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  26.17 
 
 		 580 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 891 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  24.94 
 
 		 944 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  25.12 
 
 		 689 aa  118  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  25.75 
 
 		 808 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  26.45 
 
 		 547 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  25.87 
 
 		 578 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  23.71 
 
 		 682 aa  114  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  25.3 
 
 		 864 aa  114  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.71 
 
 		 685 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  24.19 
 
 		 684 aa  111  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  23.92 
 
 		 870 aa  111  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  22.99 
 
 		 630 aa  111  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  23.99 
 
 		 636 aa  111  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  30.93 
 
 		 696 aa  110  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  24.24 
 
 		 684 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  24.01 
 
 		 684 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  23.57 
 
 		 683 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  23.13 
 
 		 682 aa  110  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.12 
 
 		 684 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  24.28 
 
 		 657 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  23.99 
 
 		 682 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  23.95 
 
 		 683 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  23.95 
 
 		 683 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  23.54 
 
 		 683 aa  108  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  23.72 
 
 		 683 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  23.95 
 
 		 683 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  22.73 
 
 		 668 aa  107  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  23.02 
 
 		 683 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  24.21 
 
 		 1421 aa  106  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  23.49 
 
 		 688 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  23.63 
 
 		 426 aa  105  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.76 
 
 		 894 aa  105  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.6 
 
 		 706 aa  104  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  27.12 
 
 		 819 aa  104  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  26.01 
 
 		 829 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  30.41 
 
 		 660 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  23.57 
 
 		 567 aa  103  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  28.38 
 
 		 682 aa  103  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  22.86 
 
 		 591 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  28.47 
 
 		 655 aa  102  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  22.38 
 
 		 692 aa  101  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  27.27 
 
 		 733 aa  101  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  22.2 
 
 		 424 aa  100  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  22.46 
 
 		 424 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  23.14 
 
 		 719 aa  100  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  21.82 
 
 		 717 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  21.03 
 
 		 589 aa  99.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  22.32 
 
 		 926 aa  100  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  23.65 
 
 		 887 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2522  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 619 aa  99.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.417958 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  23.65 
 
 		 887 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  24.43 
 
 		 655 aa  97.8  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  22.53 
 
 		 946 aa  97.8  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  26.29 
 
 		 689 aa  97.4  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  30.68 
 
 		 494 aa  97.8  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  22.81 
 
 		 458 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  22.81 
 
 		 460 aa  97.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  21.46 
 
 		 915 aa  97.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  31.02 
 
 		 451 aa  97.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  28.49 
 
 		 686 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  28.49 
 
 		 686 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  28.21 
 
 		 686 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  28.21 
 
 		 686 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  23.42 
 
 		 882 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  27.57 
 
 		 775 aa  96.3  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  22.58 
 
 		 500 aa  95.9  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.8 
 
 		 718 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  28.45 
 
 		 686 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  22.75 
 
 		 718 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>