More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2522 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2522  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 619 aa  1266    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.417958 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  27.79 
 
 		 764 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  27.08 
 
 		 614 aa  110  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  25.47 
 
 		 667 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  22.41 
 
 		 868 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1859  type II and III secretion system protein  21.64 
 
 		 861 aa  108  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.765108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1462  type II and III secretion system protein  23.15 
 
 		 769 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  21.15 
 
 		 822 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1469  type II and III secretion system protein  21.45 
 
 		 792 aa  102  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2293  type II and III secretion system protein  23.6 
 
 		 621 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3478  type II and III secretion system protein  23.43 
 
 		 621 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883707  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  22.33 
 
 		 754 aa  100  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  23 
 
 		 621 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  21.51 
 
 		 870 aa  98.2  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1300  type II secretion system protein D  22.85 
 
 		 667 aa  97.4  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.194357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  23.83 
 
 		 625 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  24.02 
 
 		 760 aa  95.9  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  21.58 
 
 		 657 aa  93.6  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  23.08 
 
 		 812 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  24.02 
 
 		 656 aa  90.5  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  26.71 
 
 		 783 aa  89.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  22.3 
 
 		 615 aa  87  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  25 
 
 		 698 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  19.87 
 
 		 779 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  25.55 
 
 		 805 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1679  type II secretory pathway, component HofQ  21.2 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  20.4 
 
 		 734 aa  81.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  21.39 
 
 		 789 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  24.92 
 
 		 807 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  25.39 
 
 		 787 aa  76.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  25.24 
 
 		 793 aa  77  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  20.35 
 
 		 749 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  24.1 
 
 		 682 aa  75.5  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  28.02 
 
 		 796 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  23.53 
 
 		 773 aa  74.3  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  23.64 
 
 		 736 aa  73.9  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  25.71 
 
 		 681 aa  73.9  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  25.93 
 
 		 803 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  19.12 
 
 		 653 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  21.23 
 
 		 780 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  23.5 
 
 		 751 aa  71.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  24.85 
 
 		 1421 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  24.53 
 
 		 748 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  27.64 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  24.76 
 
 		 748 aa  68.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  23.99 
 
 		 804 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  21.54 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  23.68 
 
 		 793 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 634 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  21.16 
 
 		 870 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  23.08 
 
 		 789 aa  67.8  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  24.84 
 
 		 740 aa  67.8  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  31.9 
 
 		 881 aa  67.4  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  24.84 
 
 		 689 aa  66.6  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  31.25 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  23.57 
 
 		 775 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  24.4 
 
 		 738 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2619  type II and III secretion system protein  26.63 
 
 		 662 aa  66.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  33.85 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  23.81 
 
 		 645 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  33.08 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  22.94 
 
 		 702 aa  65.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  25.68 
 
 		 747 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  24.44 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  23.77 
 
 		 641 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  24.44 
 
 		 781 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  23.66 
 
 		 805 aa  64.7  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  26.16 
 
 		 799 aa  65.1  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  24.67 
 
 		 752 aa  64.7  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  31.9 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  22.78 
 
 		 891 aa  63.9  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  26.89 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  24.69 
 
 		 753 aa  63.9  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  22.78 
 
 		 779 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  21.22 
 
 		 584 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  23.87 
 
 		 771 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  24.85 
 
 		 675 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  21.35 
 
 		 774 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  23.25 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  24.8 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  22.29 
 
 		 774 aa  63.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  23.87 
 
 		 777 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  28.29 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  31.62 
 
 		 714 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0735  type II and III secretion system protein  23.7 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  23.03 
 
 		 758 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  22.73 
 
 		 686 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  21.61 
 
 		 584 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  22.15 
 
 		 660 aa  62  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  23.99 
 
 		 756 aa  62  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  23.15 
 
 		 783 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  32.5 
 
 		 494 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  27.78 
 
 		 720 aa  62  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  23.64 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  30.77 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  23.38 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  29.2 
 
 		 602 aa  61.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  23.4 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  24.07 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  23.3 
 
 		 662 aa  60.8  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>