More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1469 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  45.52 
 
 		 822 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1859  type II and III secretion system protein  54.38 
 
 		 861 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.765108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  54.93 
 
 		 868 aa  648    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1469  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 792 aa  1603    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1462  type II and III secretion system protein  71.67 
 
 		 769 aa  855    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  54.58 
 
 		 870 aa  636    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  45.36 
 
 		 796 aa  634  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1679  type II secretory pathway, component HofQ  33.89 
 
 		 767 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  30.56 
 
 		 779 aa  350  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  30.74 
 
 		 754 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  29.35 
 
 		 760 aa  304  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  33.28 
 
 		 656 aa  302  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  31.31 
 
 		 749 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  31.1 
 
 		 653 aa  281  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  34.23 
 
 		 698 aa  273  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  31.8 
 
 		 667 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  36.43 
 
 		 657 aa  269  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1300  type II secretion system protein D  34.44 
 
 		 667 aa  260  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.194357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  31.96 
 
 		 614 aa  258  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3478  type II and III secretion system protein  31.38 
 
 		 621 aa  254  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883707  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  31.23 
 
 		 812 aa  254  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  29.38 
 
 		 734 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2293  type II and III secretion system protein  31.22 
 
 		 621 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  31.8 
 
 		 621 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  32.16 
 
 		 625 aa  250  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2619  type II and III secretion system protein  29.12 
 
 		 662 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  32.02 
 
 		 615 aa  244  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  30.35 
 
 		 789 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  26.38 
 
 		 764 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3789  type II and III secretion system protein  26.68 
 
 		 596 aa  167  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2522  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 		 619 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.417958 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  24.59 
 
 		 915 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  28.91 
 
 		 819 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  30.53 
 
 		 660 aa  108  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  23.02 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  28.31 
 
 		 720 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  22.74 
 
 		 589 aa  103  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  27.49 
 
 		 752 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  28.25 
 
 		 689 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  24.94 
 
 		 870 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  25.38 
 
 		 696 aa  102  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  28.77 
 
 		 829 aa  101  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  28.7 
 
 		 751 aa  100  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  24.04 
 
 		 1421 aa  100  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  24.64 
 
 		 864 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  23.21 
 
 		 891 aa  100  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  28.9 
 
 		 454 aa  99  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  26.53 
 
 		 716 aa  99  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  23.45 
 
 		 547 aa  98.2  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  23.94 
 
 		 578 aa  98.2  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  24.43 
 
 		 426 aa  97.8  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  25.64 
 
 		 672 aa  97.8  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  26.92 
 
 		 780 aa  97.4  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  25.84 
 
 		 658 aa  96.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  25.8 
 
 		 686 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  22.6 
 
 		 729 aa  96.3  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  29.41 
 
 		 740 aa  96.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  24.86 
 
 		 492 aa  96.3  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  25.8 
 
 		 686 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  25.8 
 
 		 686 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  25.8 
 
 		 686 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  24.84 
 
 		 630 aa  96.3  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  26.35 
 
 		 686 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  26.12 
 
 		 655 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.48 
 
 		 685 aa  95.1  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  30.12 
 
 		 469 aa  95.5  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  23.11 
 
 		 684 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  34.78 
 
 		 494 aa  95.1  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  22.89 
 
 		 684 aa  95.1  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  25.32 
 
 		 640 aa  94.7  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  27.19 
 
 		 775 aa  94.7  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  25.44 
 
 		 767 aa  94.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  27.19 
 
 		 775 aa  94.4  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  24.84 
 
 		 636 aa  93.6  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  26.11 
 
 		 655 aa  93.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  21.58 
 
 		 412 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  21.58 
 
 		 412 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  26.45 
 
 		 675 aa  93.2  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  23.87 
 
 		 689 aa  92.8  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  21.58 
 
 		 412 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  35.16 
 
 		 881 aa  93.2  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  26.58 
 
 		 681 aa  92.8  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  23.54 
 
 		 684 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  32.95 
 
 		 439 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  22.68 
 
 		 683 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  32.95 
 
 		 423 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  22.27 
 
 		 683 aa  92.4  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  28.66 
 
 		 473 aa  92.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  22.68 
 
 		 683 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  21.34 
 
 		 412 aa  92  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  27.84 
 
 		 779 aa  92  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  27.04 
 
 		 733 aa  92  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  21.34 
 
 		 412 aa  92  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  23.92 
 
 		 926 aa  92  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  26.69 
 
 		 781 aa  92  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  25.72 
 
 		 640 aa  92  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  22.44 
 
 		 683 aa  92  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  22.68 
 
 		 683 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  24.47 
 
 		 748 aa  91.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  21.34 
 
 		 412 aa  91.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>