More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2310 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2310  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 443 aa  899    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  37.59 
 
 		 436 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  38.11 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  36.34 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4345  type II and III secretion system protein  38.5 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2920  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  37.53 
 
 		 595 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6875  type II and III secretion system protein  37.04 
 
 		 561 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0246  type II and III secretion system protein  34.12 
 
 		 714 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2693  type II and III secretion system protein  36.69 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2117  type II and III secretion system protein  34.11 
 
 		 356 aa  204  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  31.37 
 
 		 482 aa  186  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  29.4 
 
 		 493 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  31.47 
 
 		 495 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  31.14 
 
 		 484 aa  172  9e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  30.93 
 
 		 493 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  33.74 
 
 		 490 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  30.68 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  31.88 
 
 		 526 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  29.81 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  31.02 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  31.02 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  31.18 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  33.33 
 
 		 443 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  29.65 
 
 		 460 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  30.57 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  31.86 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  31.52 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  32.63 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  32.63 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  32.63 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  28.98 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  29 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  28.53 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  32.26 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  32.1 
 
 		 461 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  30.63 
 
 		 454 aa  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  31.71 
 
 		 441 aa  153  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  30.37 
 
 		 473 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  30.49 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  30.07 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  30.05 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  30.05 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  30.05 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  30.05 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  31.36 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  30.05 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  30 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  30.07 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  29.8 
 
 		 487 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  30.16 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  30.16 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  29.06 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  30.16 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  30.16 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  30.17 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  37.1 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  29.67 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  31.47 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  31.47 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  29.24 
 
 		 491 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  31.47 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  29.06 
 
 		 484 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  30.61 
 
 		 443 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  29.3 
 
 		 530 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  29.56 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  28.78 
 
 		 539 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  29.85 
 
 		 497 aa  139  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  30.93 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  30.1 
 
 		 474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  29.68 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  29.23 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  26.89 
 
 		 520 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  29.65 
 
 		 455 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  28.89 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  28.19 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  27.03 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  27.89 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  27.99 
 
 		 428 aa  133  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  26.46 
 
 		 571 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  26.51 
 
 		 514 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 		 473 aa  133  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  28.38 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  34.35 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  29.03 
 
 		 494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  27.53 
 
 		 652 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  27.79 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  26.77 
 
 		 545 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  34.72 
 
 		 491 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  31.3 
 
 		 452 aa  129  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  26.76 
 
 		 657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  27.4 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  26.59 
 
 		 656 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  26.43 
 
 		 574 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  30.03 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  30.03 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  27.81 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  26.79 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  26.77 
 
 		 620 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>